（一）青苗及地上附着物的补偿
承包方已将土地承包经营权以转包、出租等方式流转给第三人的，除当事人另有约定外，青苗补偿费归实际投入人所有，地上附着物补偿费归附着物所有人所有。
接包人、承租人在接收土地后，会投入大量的劳力与资金，作为实际用益人就依法享有地上青苗的物权取得权，青苗补偿费作为青苗的代位物，当然应由青苗的所有权人取得。
因此，在土地承包经营权被转包、出租后承包地被征收的，应依下列规则确定青苗补偿费的归属:
1、当事人之间在转包合同和出租合同中有明确约定的，从其约定；
2、当事人之间无明确约定的，由资金和劳力的实际投入人取得。
地上附着物是指房屋等建筑物和其他构筑物。如果地上附着物由原土地承包经营权人修建，在转包和出租时接包人和承租人仅依约定取得附着物使用权的，则附着物补偿费归原土地承包经营权人所有；如果在转包和出租时地上附着物的所有权发生变动，由接包人和承租人取得所有权的，则附着物补偿费归接包人和承租人所有。
（二）土地补偿费与安置补助费
土地承包经营权转包、出租后，接包人、承租人对承包地的用益权是一种债权性权利，属承包地的债权性利用方式。因此，接包人、承租人不是土地承包经营权丧失的补偿权利人，其无权请求土地补偿费中的土地承包经营权补偿，该笔补偿费应由作为物权人的转包人、出租人取得。
应当注意的是，接包人、承租人作为征地的利害关系人并非毫无权利。当其权利受有损害时，应通过以下途径解决：
一是转包人和接包人、出租人和承租人事先在转包合同、出租合同中约定承包地被征收时对接包人和承租人的补偿方式和补偿计算标准；
二是当事人在转包合同、出租合同中未作任何约定的，可以选择以下三种规则之一处理：
其一，若通过调整土地，原土地承包经营权人重新取得等质、等量的承包地的，当事人之间的转包合同、出租合同继续于调换地上存续，当事人对合同的标的物作出变更即可；
其二，由接包人、承租人直接向征收人请求补偿；
其三，由接包人、承租人向转包人、出租人依合同法的有关规定请求补偿。就我国目前的法律而言，变更合同标的物和向原土地承包经营权人请求补偿的规则更具可操作性。
安置补助费的归属问题，关键在于接包人、承租人是否属于被安置的对象范围。根据《农村土地承包经营权流转管理办法》的规定，接包人应是“同一集体经济组织的其他农户”，但对承租人却没有任何的身份限制。
由于征地安置的对象限于被征地集体经济组织的成员，因而依《农村土地承包经营权流转管理办法》的规定，接包人属于安置的对象范围，而承租人要视其是否为同一集体经济组织的成员而定。如果承租人属于集体经济组织之外的其他单位或者个人的，其当然无权要求安置补助费。
安置补助费是指用地单位对征地单位安置因征地后造成的多余劳动力所需之费用而支付的补助金额。土地补偿费归农村集体经济组织所有;地上附着物及青苗补偿费归地上附着物及青苗的所有者所有。征用土地的安置补助费必须专款专用，不得挪作他用。需要安置的人员由农村集体经济组织安置的，安置补助费支付给农村集体经济组织，由农村集体经济组织管理和使用;由其他单位安置的，安置补助费支付给安置单位;不需要统一安置的，安置补助费发放给被安置人员个人或者征得被安置人员同意后用于支付被安置人员的保险费用。
承包地被依法征收，放弃统一安置的家庭承包方，请求发包方给付已经收到的安置补助费的，应予支持，安置补助费是对被征地农户丧失土地承包经营权或租赁经营权的补偿，不属于农村集体经济组织所有，它必须专款专用，用于安置被征地农民。如被征地的农民放弃统一安置的，集体经济组织应将收到的征地安置补助费支付给被征地的农民。
（一）土地补偿费归农村集体经济组织所有。农村集体经济组织有的是村集体（并非村委会）有的是村民小组集体。村集体有权以村民会议或村民代表会议的形式，决定征地补偿费的分配和使用，村集体可以将该集体收入用于开办集体企业，发展公益建设，可以分配到各户，可以分配给被征用承包经营土地的村民。而村集体依法对其所有征地补偿款作出的处理，应承认其合法性。若村集体将征地补偿费进行分配，则该部分征地补偿费权属依法发生转移，集体与成员间因分配决议而产生了权利义务关系。
（二）地上附着物及青苗补偿费归地上附着物及青苗的所有者所有。
（三）对于安置补偿费的归属，需要安置的人员由农村集体经济组织安置的，安置补助费支付给农村集体经济组织，由农村集体经济组织管理和使用；由其他单位安置的，安置补助费支付给安置单位；不需要统一安置的，安置补助费发放被征地土地上的个人支付的因土地征用而丧失赖以生存的土地的一种补助性费用，是对失去土地的农民提供的一个社会保障。依据土地管理法实施条例第26条第2款之规定，征用土地的安置补助费必须专款专用，不得挪作他用。
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