根据《医疗事故处理条例》规定，发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书。协议书应当载明双方当事人的基本情况和医疗事故的原因、双方当事人共同认定的医疗事故等级以及协商确定的赔偿数额等，并由双方当事人在协议书上签名。已确定为医疗事故的，卫生行政部门应医疗事故争议双方当事人请求，可以进行医疗事故赔偿调解。调解时，应当遵循当事人双方自愿原则，并应当依据本条例的规定计算赔偿数额。经调解，双方当事人就赔偿数额达成协议的，制作调解书，双方当事人应当履行；调解不成或者经调解达成协议后一方反悔的，卫生行政部门不再调解。医疗事故赔偿，应当考虑下列因素，确定具体赔偿数额：（一）医疗事故等级；（二）医疗过失行为在医疗事故损害后果中的责任程度；（三）医疗事故损害后果与患者原有疾病状况之间的关系。不属于医疗事故的，医疗机构不承担赔偿责任。
按照法律冲突的解决规则，不同位阶的法律发生冲突时，高位阶的法律效力优于低位阶的法律效力。只有同一位阶的法律发生冲突时，才适用“特别法优于普通法”。在医疗事故处理领域，《民法通则》与《条例》都是可以适用的法律形式，但是二者的位阶不同，地位和效力等级有别。《民法通则》属基本法律，是宪法之下效力最高的法律之一。宪法规定，行政法规不得同法律相抵触。《条例》是由国务院制定的行政法规。《条例》的位阶低于一般法《民法通则》，故不得同《民法通则》相抵触。
医疗事故处理条例哪些是没有规定的：
一、没有规定“死亡赔偿金”。
二、没有规定“残疾护理费”。
三、严格限定精神损害抚慰金的数额。
四、将自然科学原因力取代了民法的因果关系。
直接原因并非就是主要原因，间接原因也并非是次要原因。法律上的因果关系并非等同于自然科学事实上的因果关系。《条例》直接将自然科学的原因力取代了民法的因果关系，进一步将原因力的大小来确定赔偿责任，完全与民法原理背道而驰。
1、人们法律意识增强，医疗事故诉讼案件逐年增多
过去，医疗纠纷发生后，许多病人及家属采取一些较为冲动或激烈的方式来处理，致使纠纷不断恶化。近几年，国家实施的全民普法教育已收到明显的成效，人们的法律意识得到增强，病人及家属已开始自觉地采用法律手段来保护其合法权益，如向有关专家咨询、聘请律师与医疗单位进行交涉、及时提出医疗事故技术鉴定申请，或向法院提起民事诉讼等。几年来，各地法院受理的医疗事故诉讼案件逐年上升。
2、新闻媒介特别关注，医疗纠纷不断见诸报刊
近年来，读者们经常可以在各类报刊或杂志上看到有关医疗事故纠纷的报导，一些影响严重的医疗事故不断被爆光，引起了社会对医疗事故问题的普遍关注。应该说产生这种现象的原因是多方面的，但我认为且亲身体会到其中一个重要的原因，是病人及家属希望得到社会舆论的支持和同情。众所周知，在处理医疗事故纠纷过程中，由于我国有关法规主要是从保护医疗单位利益出发的，缺少对病人权利足够的尊重和保护，因此病人及家属往往处于一种相当不利的地位。更由于病人及家属对一些医疗事故鉴定公正性的怀疑或失望，使得他们不得不求助社会舆论的力量。这确是一件令人遗憾的现象。
3、要求赔偿数额不断增高，法院逐渐采纳赔偿原则
人的生命和健康是无价的。但是为了使生命和健康受到伤害者或其亲属在心理上得到慰藉，在物质上得到补偿，以弥补侵权行为给受害人所造成的损害，故而法律规定了民事赔偿原则。目前，对于医疗事故的处理，还有许多人（主要是医务界）认为不应适用赔偿原则。但令病人及家属欣慰的是，司法界却普遍认为十年前颁布的《医疗事故处理办法》所确定的低额“补偿”缺乏足够的公正性和合理性，不足以弥补病人所受到的实际损失，因此一些法院已在审理中根据《民法通则》第119条的规定，逐渐适用民事侵权赔偿原则（注意：目前并非所有法院均如此）。与此相应，病人及家属要求的赔偿数额较之数年前已明显增高。
4、精神赔偿开始得到法院支持
在医疗事故中，受到侵害的不仅仅是病人的健康或生命，更重要的是病人及其家属的心理创伤和沉重的精神压力。实际上，有相当一部分医疗纠纷的当事人所执着追求的是并不完全是赔偿经济损失，而更多的是要求医疗单位承认其过失并赔偿其精神损失。与此同时，法院在审理有关案件过程中，也已开始考虑并支持这种合理要求。如去年，北京市朝阳区人民法院判决北京某厂职工医院向一病人支付精神损失赔偿费12万元，开创了同类精神赔偿数额之最。
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