公司清算纠纷可以以公司清算纠纷为案由立案。
公司清算案件由公司住所地人民法院管辖。公司住所地是指公司主要办事机构所在地。公司办事机构所在地不明确的，由其注册地人民法院管辖。基层人民法院管辖县、县级市或者区的公司登记机关核准登记公司清算案件；中级人民法院管辖地区、地级市以上的公司登记机关核准登记公司清算案件。
法律依据：
《中华人民共和国民事诉讼法》第二十六条
因公司设立、确认股东资格、分配利润、解散等纠纷提起的诉讼，由公司住所地人民法院管辖。
破产程序是指对资不抵债的企业进行破产处理的司法程序。法院审理破产案件的程序。在西方和其他一些国家中，债务人既不能以其现有财产清偿全部债务，又不能达成和解结束债务关系时，由法院强制执行其全部财产，使所有债权人平均受偿，而免除其余无法清偿的债务，称为破产（见破产法）。
破产程序包括三种：和解、重整和破产清算。
不能把破产案件简单地归结为清算倒闭事件；破产清算是公平清理债务的一种方法。我国企业破产法(以下简称破产法)鼓励当事人积极寻求以避免企业倒闭清算的方式来公平清理债务。
破产法设立的重整、和解和破产清算三种程序之间，存在一定的可转换性。在它们之间，当事人有一定程度的选择自由。
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