工程竣工验收程序一般分为以下几个流程：
（一）施工单位向建设单位提交工程竣工报告，申请工程竣工验收。
（二）建设单位收到工程竣工报告后，对符合竣工验收要求的工程，组织勘察、设计、施工、监理等单位和其他有关方面的专家组成验收组，制定验收方案。
（三）建设单位应当在工程竣工验收７个工作日前将验收的时间、地点及验收组名单通知负责监督该工程的工程监督机构。
（四）建设单位组织工程竣工验收。包括审阅建设、勘察、设计、施工、监理单位提供的工程档案资料；查验工程实体质量；对工程施工、设备安装质量和各管理环节等方面作出总体评价，形成工程竣工验收意见，验收人员签字。如有质量问题提出整改意见。
（五）施工单位按照整改意见及《责令整改通知书》进行整改，整改完毕后，写出《整改报告》，经建设、监理、设计、施工单位签字盖章确认后送质监站，对重要的整改内容，监督人员参加复查。
（六）验收合格后五日内，监督机构将监督报告送住建委。建设单位按有关规定报住建委备案。
法律依据：
《中华人民共和国建筑法》第六十一条
交付竣工验收的建筑工程，必须符合规定的建筑工程质量标准，有完整的工程技术经济资料和经签署的工程保修书，并具备国家规定的其他竣工条件。
建筑工程竣工经验收合格后，方可交付使用；未经验收或者验收不合格的，不得交付使用。
（一）按月结算。实行旬末或月中预支，月终结算，竣工后清算的方法。跨年度竣工的工程，在年终进行工程盘点，办理年度结算。
（二）竣工后一次结算。建设项目或单项工程全部建筑安装工程建设期在１２个月以内，或者工程承包价值在１００万元以下的，可以实行工程价款每月月中预支，竣工后一次结算。
（三）分段结算。即当年开工，当年不能竣工的单项工程或单位工程按照工程形象进度，划分不同阶段进行结算。
（四）目标结算方式。即在工程合同中，将承包工程的内容分解成不同的控制界面，以业主验收控制界面作为支付工程款的前提条件。也就是说，将合同中的工程内容分解成不同的验收单元，当施工单位完成单元工程内容并经业主经验收后，业主支付构成单元工程内容的工程价款。
（一）工程价款结算应该按照合同约定进行办理。合同未作约定或者约定不明的，应该依照相关规定与文件协商处理。
（二）当事人对合同造价有争议无法协商解决的，可以通过向人民法院提起诉讼或者申请仲裁。
（三）《建设工程价款结算暂行办法》第十一条 工程价款结算应按合同约定办理，合同未作约定或约定不明的，发、承包双方应依照下列规定与文件协商处理：
（１）国家有关法律、法规和规章制度；
（２）国务院建设行政主管部门、省、自治区、直辖市或有关部门发布的工程造价计价标准、计价办法等有关规定；
（３）建设项目的合同、补充协议、变更签证和现场签证，以及经发、承包人认可的其他有效文件；
（４）其他可依据的材料。
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