南京居住证的办理流程如下：
（一）申请：
用人单位与流动人口建立劳动关系，自订立劳动合同之日起7日内，将劳动者信息报送公安派出所或受委托的管理服务机构，并督促其申报居住登记或居住变更登记。
用人单位与流动人口解除或终止劳动关系，自解除或终止劳动合同之日起7日内，报公安派出所或受委托的管理服务机构备案。
房屋出租人与流动人口建立租赁关系，自房屋出租之日起7日内，将承租人信息报送公安派出所或受委托的管理服务机构，并告知其申报居住登记或居住变更登记。
（二）审批：
对符合申领条件的，公安机关自受理申领之日起15个工作日内发放居住证。对不符合申领条件的，公安机关自受理申领之日起5个工作日内回复申领人并说明理由。
根据《居住证暂行条例》申领居住证，应当向居住地公安派出所或者受公安机关委托的社区服务机构提交本人居民身份证、本人相片以及居住地住址、就业、就读等证明材料。 居住地住址证明包括房屋租赁合同、房屋产权证明文件、购房合同或者房屋出租人、用人单位、就读学校出具的住宿证明等;就业证明包括工商营业执照、劳动合同、用人单位出具的劳动关系证明或者其他能够证明有合法稳定就业的材料等;就读证明包括学生证、就读学校出具的其他能够证明连续就读的材料等。 未满16周岁的未成年人和行动不便的老年人、残疾人等，可以由其监护人、近亲属代为申领居住证。监护人、近亲属代为办理的，应当提供委托人、代办人的合法有效身份证件。 申请人及相关证明材料出具人应当对本条规定的证明材料的真实性、合法性负责。 对申请材料不全的，公安派出所或者受公安机关委托的社区服务机构应当一次性告知申领人需要补充的材料。 对符合居住证办理条件的，公安机关应当自受理之日起15日内制作发放居住证;在偏远地区、交通不便的地区或者因特殊情况，不能按期制作发放居住证的，设区的市级以上地方人民政府在实施办法中可以对制作发放时限作出延长规定，但延长后最长不得超过30日。
《居住证》积分制度，是大型和特大型城市为了保障境内外来务工人员的合法权益，规范人口服务和管理，提高政府服务水平，促进经济、社会、资源、环境协调发展，实行的一项管理办法。一般来说，凡在这个城市工作、居住，持有当地《居住证》境内的外来人员可以适用。《居住证》积分制度是通过设置积分指标体系，对在当地合法稳定居住和合法稳定就业的《居住证》持有人进行积分，将其个人情况和实际贡献转化为相应的分值。积分达到标准分值的，可以享受相应的公共服务待遇。《居住证》积分管理工作由当地的市人力资源社会保障局负责，各区（县）人民政府负责在其行政区域内的具体组织实施工作。公安、教育、卫生计生、工商、税务、住房保障房屋管理、民政、经济信息化等相关部门按照各自职责，负责做好相关的服务和管理工作。《居住证》积分指标体系由基础指标、加分指标、减分指标和一票否决指标组成。基础指标包含年龄、教育背景、专业技术职称和技能等级、在当地工作及缴纳职工社会保险年限等指标。加分指标包括紧缺急需专业、投资纳税或带动本地就业、缴纳职工社会保险费基数、特定的公共服务领域、远郊重点区域、全日制应届毕业生、表彰奖励、配偶为当地户籍人员等指标。减分指标包括提供虚假材料、行政拘留记录和一般刑事犯罪记录等指标。一票否决指标是指持证人有违反国家及本市计划生育政策规定行为记录或严重刑事犯罪记录的，取消申请积分资格。《居住证》持证人需要申请积分的，可通过互联网登录当地居住证积分管理信息系统，进行网上模拟估分。达到标准分值的，向用人单位提出申请，委托用人单位向注册地区（县）人才服务中心申请积分。经审核后，积分达到标准分值的，可以享受相应的公共服务待遇。
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