1、视具体情况而论。如果法院只是撤销了行政处罚行为，那么立案就是合法有效的，行政机关可以重新做出处罚，如果立案也涉及到违法不合理问题，法院一并撤销了行政处罚和立案，那么行政机关就需要重新立案。
2、根据《行政诉讼法》第七十条：行政行为有下列情形之一的，人民法院判决撤销或者部分撤销，并可以判决被告重新作出行政行为：
（一）主要证据不足的；
（二）适用法律、法规错误的；
（三）违反法定程序的；
（四）超越职权的；
（五）滥用职权的；
（六）明显不当的。
根据《行政处罚程序》第一节第七条规定，行政机关发现违法行为后，应当进行初步审查。如果满足下列条件的应当立案：
1、有初步认定的违法行为；
2、该违法行为依法应当给予行政处罚；
3、该违法行为属于本机关管辖立案。是指确立案件，行政处罚案件的生成。行政机关对属于本机关管辖范围的违法行为或涉嫌违法行为，认为依法应当处理的，除适用简易程序外，都应当正式立案。
行政处罚的原则之一是一事不二罚，如果是同一违法行为的，不能再立案，如果对违法行为处罚后，再次犯同样违法行为的，可以立案受理。
《中华人民共和国行政处罚法》第二十四条 对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。
第三十条 公民、法人或者其他组织违反行政管理秩序的行为，依法应当给予行政处罚的，行政机关必须查明事实;违法事实不清的，不得给予行政处罚。
1、主体不同。治安处罚行政主体只能是公安机关及其工作人员，即：公安民警，还有一些被公安机关授权的乡、镇政府;而行政处罚的行政主体除了公安机关外还有税务、工商、财政、计划、海关、港务、外汇等行政主体。因此，一般情况下，公安适用的行政处罚都要加上“公安行政”的字样。
2、适用依据不同。治安处罚只能适用《治安管理处罚条例》，而行政处罚的适用，除了《治安管理处罚条例》外，还有其他的行政法。如非法持有、使用假币行为，适用《银行法》;吸食、注射毒品的行为，适用《禁毒决定》等。
3、罚则不同。治安处罚规定的处罚种类只有警告、罚款和拘留3种;而行政处罚除此之外，还有责令停产停业、吊销或暂扣执照、许可证等，且是否适用拘留、罚款数额大小等也不尽相同。
4、罚缴方式不同。治安处罚中罚款和决定和收缴由公安机关执行;而行政处罚中，一般实行罚、缴分离制，罚款决定由行政机关执行，罚款的收缴由银行执行。
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