公司清算时资产不足以清偿所有债务的，公司可以申请破产清算，法院宣告公司破产后，按优先顺序对债务进行清偿。
（一）破产人所欠职工的工资和医疗、伤残补助、抚恤费用，所欠的应当划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用，以及法律、行政法规规定应当支付给职工的补偿金；
（二）破产人欠缴的除前项规定以外的社会保险费用和破产人所欠税款；
（三）普通破产债权。破产财产不足以清偿同一顺序的清偿要求的，按照比例分配。破产企业的董事、监事和高级管理人员的工资按照该企业职工的平均工资计算。
根据《中华人民共和国公司法》第一百八十七条 【破产申请】清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，发现公司财产不足清偿债务的，应当依法向人民法院申请宣告破产。
股东能申请公司清算。根据法律规定，股东有两种途径可以申请对公司进行清算：
（一）公司自行组成清算组对公司进行清算当公司解散事由发生时，公司应当在十五日内成立清算组，开始清算。有限责任公司的清算组由股东组成，股份有限公司的清算组由董事或者股东大会确定的人员组成。然而在实践中，公司往往怠于履行清算义务或者由于股东间存在的严重矛盾和纠纷，无法启动自行清算程序。法律赋予了股东申请法院介入公司进行强制清算的救济途径。
（二）当公司具有以下情形，而债权人未提起清算程序的，公司股东申请人民法院指定清算组对公司进行清算的，人民法院应予受理。
１、公司解散逾期不成立清算组进行清算的；
２、虽然成立清算组但故意拖延清算的；
３、违法清算可能严重损害债权人或者股东利益的。
一般情况下，公司清算通常要100天左右的时间。在公司清算的过程之中，人民法院会在清算组成立那天起的十天内通知债权人。在报纸上公告是六十天内，债权人申报债权的时间是收到通知的三十天内，或者收到公告的四十五天内。清算所需的具体时间，还要根据清算流程的复杂程度来定。
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