如果存在违法行为的，相关部门是可以依法进行扣留的。
（一）《食品经营许可证》申请书，将公司的信息填上，为了避免填错可以到工商局办理点按照工作人员的提示填写，注意所有的信息必须真实。
（二）公司营业执照及复印件。
（三）食品安全制度管理文本，可以到复印店购买，或者是指定的文具店。如果店内没有悬挂安全制度管理文本条款，一定要购买悬挂，否则工商局实地检验可能无法通过。
（四）食品安全管理人员健康证、培训证复印件。（一般是公司法人）
（五）从业人员健康证（2人以上）复印件，只要公司里面有健康证的员工即可。
（六）公司平面图、地理位置图。
（七）法人身份证复印件2份。
（八）委托代理人身份证复印件。
根据《食品安全法》第八十四条的规定，无证照从事食品经营活动的，由工商行政管理部门没收违法所得、违法经营的食品和用于违法经营的工具、设备等物品，
违法经营的食品货值金额不足1万元的，并处2000元以上5万元以下的罚款；货值金额1万元以上的，并处货值金额5倍以上10倍以下的罚款。
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