补充公积金一般是指补充住房公积金，是指用人单位除了为员工缴纳住房公积金外，再额外为员工缴纳一部分钱，这部分钱和住房公积金的一样使用，只能在购房时使用。
由于一部分企业效益较好，７％的公积金缴存额度已无法适应这些企业职工的需求，但社会普遍调整公积金缴存额度存在难度，加上企业也愿意做为职工增加这部分福利，故本市有关部门去年下半年开始实施补充公积金制度。根据《补充公积金暂行办法》，除政府机关和全额财政拨款单位外，其它自收自支、效益较好的企事业单位，都可在完成法定公积金缴存比例后，再增加缴存比例，缴存方式同样是个人出多少，企业出多少。
申请补充公积金贷款的，不单独签订补充住房公积金贷款合同，而是在住房公积金贷款合同中，增加补充住房公积金贷款金额。
（一）由单位盖章的《住房公积金提取证明》
（二）由提取人填写的《公积金（补充）提取申请书》
（三）提取人及委托人身份证、户口簿或关系证明
（四）借款合同或原还款凭证
借款人向担保公司提供相关资料证明：夫妻双方（若有共同还贷人，还需提供参与还贷人）的身份证、户口薄等原件及复印件３份；借款人的婚姻状况证明及复印件３份；夫妇双方（参与还贷人）的月收入证明原件及复印件一份；占房价４０％或以上的自筹资金证明交存到房地产交易中心或售房单位出具的收据原件及复印件两份；购房合同原件和复印件２份；
申请组合贷款的借款人（含其配偶），须由单位提供单位公积金账号及本人（含其配偶）公积金月缴额（单位在《个人住房置业担保贷款申请呈报表上填写并盖章。）；
确定拟贷款额度，由贷款银行、城市房改资金管理中心、担保公司进行审批；
审批通过后签订相关合同，办理有关手续。银行发放贷款。借款人按期还本付息。
根据《上海市补充住房公积金暂行办法》，除国家机关、差额预算事业单位和社会团体及其所属的职工外，其它自收自支、效益较好的企事业单位，都可在完成法定公积金缴存比例后，再增加缴存比例，缴存方式同样是个人出多少，企业出多少。
通俗地说，补充公积金就是公司愿意为员工在交足普通公积金比例后，再出一笔钱用于公积金，员工自己也要同比例交。这是福利，不是每个公司都愿意的。
补充住房公积金的月缴存额等于职工本人上一年度的月平均工资乘以职工、单位的补充住房公积金缴存比例。职工本人和单位的补充住房公积金的缴存比例，分别不得大于各９％和少于各１％。具体缴存比例，根据单位的实际情况确定。
职工缴存的补充住房公积金，由单位在职工每月工资收入中代为扣除；单位为职工缴存的补充住房公积金，由单位承担。单位为职工缴存的和代扣的补充住房公积金，由单位自发放月工资之日起五日内，存入市公积金管理中心在市建行房地产信贷部设立的补充住房公积金专户内，并且计入职工个人补充住房公积金账户。
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