依据我国商标法的规定，国务院工商行政管理部门商标局主管全国商标注册和管理的工作，所以商标注册要向商标局申请。
第二条 国务院工商行政管理部门商标局主管全国商标注册和管理的工作。
国务院工商行政管理部门设立商标评审委员会，负责处理商标争议事宜。
第三条 经商标局核准注册的商标为注册商标，包括商品商标、服务商标和集体商标、证明商标；商标注册人享有商标专用权，受法律保护。
本法所称集体商标，是指以团体、协会或者其他组织名义注册，供该组织成员在商事活动中使用，以表明使用者在该组织中的成员资格的标志。
本法所称证明商标，是指由对某种商品或者服务具有监督能力的组织所控制，而由该组织以外的单位或者个人使用于其商品或者服务，用以证明该商品或者服务的原产地、原料、制造方法、质量或者其他特定品质的标志。
集体商标、证明商标注册和管理的特殊事项，由国务院工商行政管理部门规定。
（一）是确定商标的注册范围，并进行预先检索。商标的注册范围要根据《类似商品和服务区分表》列明的类别和商品名称来选定，选定范围后，建议进行商标检索，以评估商标注册申请是否有被驳回的风险，如果有，可以在申请注册前及时修改商标。
（二）是向商标局提交商标注册申请文件。申请文件包括：商标注册申请书、申请人的主体资格证明资料，委托知识产权代理机构提交的，还应提交授权委托书。
（三）是商标局受理并审查。商标局受理后会进行形式审查和实质审查，形式审查主要审查申请人的名称、地址、商标图样、指定商品和服务。实质审查主要审查商标是不是《商标法》规定的禁止注册和禁止使用的标识、是否与在先申请或注册的相同或近似商标相冲突。
（四）是公告。通过审查的，商标局会予以公告，公告期为3个月，在先权利人和利害关系人在这个期间可以对商标申请提出异议。
（五）是核准注册。在公告期内没有人提出异议的，商标局就会核准注册，并下发《商标注册证书》。
（一）功能和作用不同
首先商号是用来区分不同的企业，而商标是用来区分不同的商品。一般而言一个公司和企业只能有一个商号而对于商标而言则可以根据不同的商品来注册商标，在一定情况下商号有些时候还能作为商标使用，而商标则在一定程度上是不可以的。
（二）表现形式不同
根据《企业名称登记管理规定》的规定，商号一般只能用两个以上的汉子组成，而根据我国《商标法》的规定，对于商标而言是可以采用数字、图形、拼音、颜色和英文字母等来组合运用。这也可以看出两者在表现形式上存在很大的差异。
（三）使用的范围和效力不同
中国对于商标权的规定是商标一旦注册在全国范围内都是有效的，而且对于商标权的使用年限也规定在有效期十年，在过期后可以进行续展；而商号权则是有一定的区域限制，首先要通过国家工商行政管理总局核准后在一定的区域内使用，但是对于商号的使用期限这没有限制，即只要一经通过就可终身使用。
一般来说，国务院工商行政管理部门商标局主管全国商标注册和管理的工作，所以商标注册要向商标局申请。以上便是找法网小编为您带来关于商标在哪个部门注册的相关内容，若大家有什么不了解的或者是有其他疑问的可以咨询找法网的律师。
