1、当事人申请鉴定，应当在举证期限内提出。
2、申请鉴定时，要预交鉴定费用，并提供相关材料。
3、当事人申请鉴定经法院同意后，由双方当事人协商确定有鉴定资格的鉴定机构、鉴定人员，协商不成时，由人民法院指定。
4、当事人对人民法院委托的鉴定部门作出的鉴定结论有异议申请重新鉴定，提出证据证明存在下列情形之一的，人民法院应予准许：
（1）鉴定机构或者鉴定人员不具备相关的鉴定资格的。
（2）鉴定程序严重违法的。
（3）鉴定结论明显依据不足的。
（4）经过质证认定不能作为证据使用的其他情形。
5、对有缺陷的鉴定结论，可以通过补充鉴定、重新质证或者补充质证等方法解决的，不予重新鉴定。
委托书、身份证、鉴定所需的样本和检材等。
下面是委托作法医临床司法鉴定所需提供的司法鉴定材料目录：
1、鉴定委托书：载明鉴定机构名称，清楚扼要说明委托事项（道路交通事故、人身损害，职工工伤、有关期限、伤病关系等），简单阐述案情，被鉴定人和／或其代理人的联系方式等。
2、案情：若为交通事故，提供交通事故责任认定书；如无责任认定书，则说明事故经过、被告及有无商业保险等情况；其他案件，应说明办案部门查明的案情。
3、被鉴定人身份证明文件：身份证明文件须带有被鉴定人的照片，复印件亦可，用以校对是否为被鉴定人本人，防止冒名顶替，如居民身份证、机动车驾驶证、社保卡等，如为未成年人，则提供户籍材料复印件。
4、病历及辅助检查材料：病历包括伤后所有的门诊病历、入院记录、手术记录、出院记录等；辅助检查材料包括影像学片（X片、MRI片、CT片等）及检查报告、必要的实验室检查报告（如肌电图、脑电图、视听觉电生理等）
5、重新鉴定的，应该在委托书中注明，并提供原鉴定意见书；公安机关鉴定机构已作损伤程度鉴定的，应提供损伤程度鉴定意见书原件或复印件。
6、需该机构司法鉴定人员回避的，予以注明。
7、应注明委托鉴定材料的名称、数量。
司法部发布了修订后的《司法鉴定程序通则》（司法部令第132号），自2016年5月1日起正式实施。修订后的通则共六章50条，新增10条。新增加“司法鉴定人出庭作证”一章作为第五章，明确规定司法鉴定人无正当理由不得拒绝出庭作证，司法鉴定人出庭作证必须遵守诉讼程序和法庭规则，司法鉴定机构应当支持司法鉴定人出庭作证等。
以上是找法网小编为您详细介绍的关于法院申请鉴定的合法程序的内容，根据法律的相关规定，法院申请鉴定的时候需要向鉴定机构进行申请，需要缴纳一定的鉴定费用，也需要提供相关的鉴定材料，若您还有什么法律上的问题，建议咨询找法网专业律师，我们将竭诚为您服务。
