对方一旦不配合司法鉴定的相关规定，其法院可以进行相关的强制措施，让对方必须履行。而且其所造成的相关的影响也是非常严重的，其后果更加严重。
根据《最高人民法院关于适用＜中华人民共和国民事诉讼法＞的解释》第九十条 ，当事人对自己提出的诉讼请求所依据的事实或者反驳对方诉讼请求所依据的事实，应当提供证据加以证明，但法律另有规定的除外。
在作出判决前，当事人未能提供证据或者证据不足以证明其事实主张的，由负有举证证明责任的当事人承担不利的后果。这是举证责任分配的基本原则。
一方向法院依法申请司法鉴定，此鉴定必须对方配合才能完成，如笔迹鉴定，亲子鉴定等等，对方拒绝配合，会导致鉴定无法实施，无法认定需要通过鉴定确定的案件事实的结果。此时应当推定申请鉴定一方所主张的待鉴定案件事实成立。
法鉴定机构应当统一收取司法鉴定费用，收费的项目和标准执行国家的有关规定。
司法鉴定的鉴定费仍然是按照，谁提出，谁预先缴纳的原则！因此，最终的鉴定费用的承担还是与鉴定结果相关系的。按照我国司法鉴定规则的规定，经过鉴定，属于医疗机构存在医疗过错行为、造成医疗损害结果、医疗机构应当承担法律责任的，鉴定费用由医疗机构按照应当承担法律责任的比例承担法律责任。也就是说，谁提出做司法鉴定的谁应当预先缴纳鉴定费用，如果医疗机构应当承担法律责任的，由医疗机构承担法律则比例的鉴定费用，将退还部分或者全部的患者及其家属的预缴费用。如果经过鉴定医疗机构没有过错、不承担法律责任的的，谁提出的司法鉴定申请，谁负责承担鉴定费用。如果是医疗机构提出的申请的，由医疗机构承担，由患者及其家属提出的申请的，由患者及其家属承担。如果是在诉讼中，法庭申请委托的，通常是双方当事人各预交一半。
在我国的双方鉴定规则中没有具体规定，鉴定费减免的情况。但是，我国各个地方都有出台，减免交纳鉴定费的辅助性法规，对符合法律援助的委托人申请司法鉴定，凭法律援助机构受理法律援助申请的通知，或人民法院提供司法救助的通知，或司法鉴定机构所在地县级以上司法行政机关作出的应予法律援助的通知，司法鉴定机构予以减半或免收鉴定费。因此，如果患者及其家属因为，经济困难无法交纳鉴定费的，可以查看本地方的司法局的相关规定，积极申请法律援助，争取减免鉴定费用。
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