《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》对于6个月以内的病假待遇和6个月以上的长病假待遇分别作了规定，但并未将其明确限定为“医疗期内”，因此，对于医疗期满后是否应当按照病假标准支付工资，实务中存在争议。一种观点认为，医疗期满后只要没有解除劳动关系的，应给予相应的病假待遇。而另一种观点认为，对于医疗期满后是否必须支付没有明确规定，因此存在协商确定的余地，即如果企业和员工对按照事假处理达成一致，员工没有异议的，应当予以支持。从近几年的司法实务来看，只要用人单位与劳动者之间的约定不违反法律法规的强制性规定，通常还是认为有效的。
在程序上应当提前30日通知或发给一个月的代通金。
如果医疗期满后，劳动者不能从事原工作也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以依据《劳动法》第二十六条的规定，在提前30日以书面形式通知劳动者本人后，和劳动者解除劳动合同，但是应当依据原劳动部《违反和解除劳动合同的经济补偿办法》规定支付经济补偿金和医疗补助费；劳动者在本单位工作每满一年，用人单位应当发给相当于一个月工资的经济补偿金，同时单位还应发给劳动者不低于六个月工资的医疗补助费；患重病和绝症的还应增加医疗补助费，患重病的增加部分不低于医疗补助费的50%，患绝症的增加部分不低于医疗补助费的100%；其中经济补偿金的工资计算标准是指企业正常生产情况下劳动者解除合同前12月的月平均工资，劳动者的月平均工资低于企业月平均工资的，按照企业月平均工资的标准支付。如果单位不按规定给予劳动者经济补偿金，除全额发给经济补偿金外，还须按照该经济补偿金数额的5%支付额外经济补偿金。
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