合同纠纷的种类，从不同的角度来看。有不同的划分：
(一)无效合同纠纷和有效合同纠纷
(二)口头合同纠纷和书面合同纠纷
(三)国内合同纠纷和涉外合同纠纷
(四)有名合同纠纷和无名合同纠纷
(五)标准合同纠纷和非标准合同纠纷
合同纠纷的解决方式多样，一般来说，主要有以下四种：
(一)协商
合同当事人在友好的基础上，通过相互协商解决纠纷，这是最佳的方式。
(二)调解
合同当事人如果不能协商一致，可以要求有关机构调解如，一方或双方是国有企业的，可以要求上级机关进行调解。上级机关应在平等的基础上分清是非进行调解，而不能进行行政干预。当事人还可以要求合同管理机关、仲裁机构、法庭等进行调解。
(三)仲裁
合同当事入协商不成，不愿调解的，可根据合同中规定的仲裁条款或双方在纠纷发生后达成的仲裁协议向仲裁机构申请仲裁。
(四)诉讼
如果合同中没有订立仲裁条款，事后也没有达成仲裁协议，合同当事人可以将合同纠纷起诉到法院，寻求司法解决。除了上述一般特点之外，有些合同还具有其自愿的特点，如涉外合同纠纷，解决时可能会援引外国法律、而不是中国相关的合同方面的法律。
合同纠纷处理的环节，存在以下几个主要风险：
1、未建立合同纠纷处理的有效机制，纠纷处理不当，导致单位利益受损；
2、未收集充分的对方违约行为的证据，导致单位在纠纷处理过程中处于举证不力的地位；
3、为按照合同约定追究对方的违约责任，可能导致单位应享有的利益受损。
行政事业单位对于发生的合同纠纷，应当明确合同纠纷的处理方式及相关审批权限和处理责任，纠纷处理过程中，未经批准，相关经办人员不能做出实质性的答复或承诺。
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