软件著作权登记应在中国版权保护中心进行办理。根据《计算机软件著作权登记办法》第九条规定，申请软件著作权登记的，应当向中国版权保护中心提交以下材料：
（一）按要求填写的软件著作权登记申请表；
（二）软件的鉴别材料；
（三）相关的证明文件。
（四）《计算机软件著作权登记办法》第五条申请人或者申请人之一为外国人、无国籍人的，适用本办法。第六条国家版权局主管全国软件著作权登记管理工作。国家版权局认定中国版权保护中心为软件登记机构。经国家版权局批准，中国版权保护中心可以在地方设立软件登记办事机构。
（一）软件著作权个人登记，是指自然人对自己独立开发完成的非职务软件作品，通过向登记机关进行登记备案的方式进行权益记录、保护的行为。
（二）软件著作权企业登记，是指具备、不具备法人资格的企业对自己独立开发完成的软件作品或职务软件作品，通过向登记机关进行登记备案的方式进行权益记录、保护的行为。
（一）按要求填写的软件著作权登记申请表
（二）软件的鉴别材料，包括程序和文档的鉴别材料
（三）自然人、法人或者其他组织的身份证明
（四）有著作权归属书面合同或者项目任务书的，应当提交合同或者项目任务书
（五）经原软件著作权人许可，在原有软件上开发的软件，应当提交原著作权人的许可证明
（六）权利继承人、受让人或者承受人，提交权利继承、受让或者承受的证明。
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