发生医疗事故的赔偿等民事责任争议时，有三条解决途径可供选择：一是医患双方协商解决;二是当事人向卫生行政部门提出调解申请;三是直接向人民法院提起民事诉讼。
从目前情况看，大部分医疗纠纷的处理都经历了双方协商这一程序。应该说，这也是最经济、最便捷的一条解决途径，然而，由于种种因素的影响，协商不一定能达成共识，甚至可能久拖不决。对此，患者方须特别引起注意，因为医疗侵权诉讼的时效以及向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请的时效为1年，自当事人知道或应当知道其身体健康受到损害之日起算。
首先，进行协商处理。在协商争议时，请医疗事故技术鉴定委员会进行鉴定。再有有争议时，由卫生行政部门处理。对结果不服的，在接到鉴定报告书之日起，15日内向上一级申请重新鉴定。或向当地人民法院起诉。
医疗事故诉讼纠纷根据纠纷案由的不同，有不同的诉讼时效的规定，根据最新的民法总则的相关规定，请求保护民事权利的诉讼时效为三年，法律另有规定的除外。
根据民法通则第136条的规定，身体受到伤害要求赔偿的、出售质量不合格的商品未声明的、延付或拒付租金的和寄存财务被丢失或者损毁的，诉讼时效均为一年。因此，若是以侵权造成患者身体受到损害的案由来进行医疗事故诉讼的，诉讼时效为一年。
除了侵权之诉外，医疗事故纠纷还可能是由于医方违反了医疗服务合同的约定，损害了患者的身体健康，需要承担对应的违约责任，根据合同纠纷提起的诉讼时效，按照一般的诉讼时效的规定，有三年的诉讼时效。
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