棚户区改造房是可以有房产证。但是涉及很多的问题：
１、短期内不能办理。原因多方面，政府主要是考虑不能确权这么多的房子，冲击房地产市场。
２、缴纳税赋不确定。因为负责棚户区改造的房地产是很吃亏的，房地产先投入资金改造棚户区，处在资金链不健全的时候，是不可能负责老百姓这部分的税款的。因为房地产没有销售业绩啊，没有销售出一套房，但棚户区改造老百姓是要缴纳契税。
３、改造后因此而产生了许多的二套房三套房甚至多套房，政府怎么收这部分房子的税肯定要定高税价，政府也很难定这部分的税赋。
对相关的房屋进行拆迁补偿，拆迁工作统一由地方政府委托相关单位办理拆迁事宜；政府会事先发出拆迁公告和补偿标准的公告，被征收人如果不同意补偿的方式和数额等，可以协商处理，协商不成的可以提起行政诉讼，要求法院予以裁决。
对于集体土地上的棚改，其补偿方式有三种，一种是货币补偿，一种是产权置换，另一种就是迁建安置。
选择房产置换的，一般是按照拆一还一的原则，当然也要看具体情况，有的时候则大于拆一还一的原则，有时则小于拆一还一的原则。
选择货币补偿的，如果房屋已经纳入到城市规划区内，则补偿应当参照周边市场价进行补偿。
选择迁建安置，一般是有条件的可以先选择宅基地迁建安置，另补偿房屋重建成本价。
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