从设立的依据和特征来看。
1、合伙企业是根据《合伙企业法》在中国 境内设立的普通合伙企业和有限合伙企业，其一般无法人资格。其特征有：合伙协议是合伙得以成立的法律基础。合伙协议是处理合伙人相互之间的权利义务关系的内部法律文件，仅具有对内的效力，即只约束合伙人，所以合伙协议是调整合伙关系、规范合伙人相互之间的权利义务、处理合伙纠纷的法律基础，也是合伙得以成立的法律基础此即合伙的契约性。合伙协议性质上区别于公司法人章程。合伙需是由两个或两个以上的人组合形成的经营组织，须由合伙人共同出资、共同经营、共负盈亏，共担风险并共同从事经营活动，从而分享经营所得;它较独资经营具有集中力量，共同举办某种事业的特点。
2、有限责任公司是根据《公司登记管理条例》的规定登记注册，由两个以上、五十个以下的股东共同出资，每个股东以其所认缴的出资额对公司承担有限责任，公司以其全部资产对其债务承担责任的经济组织。有限责任公司包括国有独资公司以及其他有限责任公司。其特征有：有限责任公司具有法人资格，法人是一种社会组织，是集合的主体。这种组织机构具有对外统一性和相对稳定性，不因为法人成员的死亡或退出法人组织及其他变化而影响其民事权利主体资格的存续。法人的这一特征，使其区别于单独的自然人;法人拥有独立的财产和人格，并能独立承担民事责任的组织体。法人的独立财产是其从事民事活动的物质基础，也是其最大的法律特征;其与自然人一样具有独立人格、享有独立地位的民事主体，能以自己的名义实施法律行为，以其自己的财产承担独立于成员的有限责任。
从设立条件来看。
1、出资人数要求：合伙企业根据《合伙企业法》规定，应该由2个以上的合伙人出资设立，其中有限合伙企业应由2人以上50人以下的合伙人出资设立;有限责任公司由50人以下的股东出资设立。
2、 出资方式要求：合伙企业根据《合伙企业法》规定，合伙人可以用货币、实物、知识产权、土地使用权或者其他财产权利出资，也可以用劳务出资。但是，有限合伙企业中的有限合伙人则不能以劳务出资;有限责任公司其股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资;但是，法律、行政法规规定不得作为出资的财产除外。相对于有限责任公司股东而言，合伙企业的合伙人在出资方式上更为灵活，突出表现为普通合伙人可以劳务出资。
1、股权表现形式差异
有限责任公司里，权益总额不作等额划分，股东的股权是通过所认缴的出资额比例来表示，股东表决和偿债时以其认缴的出资额比例享有权利和承担责任;而股份公司的全部资本分为数额较小、每一股金额相等股份，股东的表决权按认缴的出资额计算，每股有一票表决权。
2、设立方式及流程差异
有限责任公司只能由发起人集资，不能向社会公开募集资金，也不能发行股票，不能得上市。设立流程为 ：订立公司章程——股东缴付出资——验资机构验资——设立登记;股份有限公司除了可以使用有限责任公司的设立方式外，还可以向社会公开筹集资金并上市融资，但设立流程比较复杂：订立公司章程——发起人认购股份和向社会公开募集股份——验资——召开创立大会——设立登记。
3、股东人数限制
有限责任公司的股东不得多于50人，保护了公司的封闭性;股份有限公司必须有2-200发起人，股东人数无限制，上市公司拥有上百万人的股民都是公司股东。
4、公司资本规模
除了上海自贸区内的有限责任公司、股份公司取消最低注册资本要求外，其余地区的有限公司最低注册资本为三万元，股份公司最低注册资本为五百万元，上市公司五千万元。目前国务院已经开会要求全国推广取消最低注册资本制度，貌似各地尚未执行细则。
5、组织机构设置规范化程度不同
有限公司比较简单、灵活，可以通过章程约定组织机构，可以只设董事、监事各一名，不设监事会、董事会;股份有限公司的要求高，必须设立董事会、监事会，定期召开股东大会，而上市公司在股份公司的基础上，还要聘用外部独立董事。
6、股权转让与股权的流动性
有限责任公司，股东之间可以相互转让出资额。向股东以外的人转让出资时，必须经股东会过半数股东同意，因而股权的流动性差，变现能力弱;而股份有限公司的股票公开发行，转让不受限制，上市公司股票则流动性更高，融资能力更强
7、社会公开
有限责任公司的生产、经营、财务状况，只需按公司章程规定的期限向股东公开，供其查阅，无须对外公布，财务状况相对保密;股份有限公司，并且要定期公布财务状况，上市公司要通过公共媒体向公众公布财务状况，相比较更难操作，公司财务状况也难于保密，更容易涉及信息披露、内幕交易等问题。
主要包括在股权表现形式方面和设立及流程，以及股东人数和公司的资本等这都是不一样的。国家规定，有限责任公司的股东最多不得多于50人，但是股份有限公司不是如此的，股东人数并没有具体的限制。另外在社会公开的透明程度上，两者也有根本的区别，相对来说，股份有限公司的经营更加的公开透明。
一、设立依据所谓设立的依据，即设立该种企业组织形式的法律规定。1、有限合伙企业：主要是《中华人民共和国合伙企业法》（2006年修订，以下简称“合伙企业法”）和《中华人民共和国合伙企业登记管理办法》（2007年修订）。2、有限责任公司：主要是《中华人民共和国公司登记管理条例》（2005年修订）。
二、出资人数1、有限合伙企业：应由2人以上50人以下的合伙人出资设立，至少应当有1名普通合伙人。注：《合伙企业法》第六十一条2、有限责任公司：应由50人以下的股东出资设立。
三、出资方式1、有限合伙企业：合伙人可以用货币、实物、知识产权、土地使用权或者其他财产权利出资，普通合伙人也可以用劳务出资。注：《合伙企业法》第十六条、六十条、六十四条2、有限责任公司：股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资；但是，法律、行政法规规定不得作为出资的财产除外。此外，货币出资金额不得低于注册资本的30%。相对于有限责任公司而言，有限合伙企业的合伙人在出资方式上更为灵活，突出表现为普通合伙人可以劳务出资，而且货币出资的比例没有要求。
四、注册资本1、有限合伙企业：没有注册资本的要求，合伙人应当按照合伙协议约定的数额履行出资义务。注：《合伙企业法》第十七条、六十条、六十五条2、有限责任公司：注册资本的最低限额为人民币3万元，其中一人有限责任公司注册资本的最低限额为人民币10万元。财务分析法律、行政法规对有限责任公司注册资本的最低限额有较高规定的，从其规定。小结：有限责任公司实行注册资本制，注册资本为在公司登记机关登记的全体股东认缴的出资额；有限合伙企业实行承诺出资制，合伙人如何出资，取决于协议约定，没有强制性规定。
五、组织机构1、有限合伙企业：未对最高权力机构予以明确，原则上合伙企业重大事务由全体合伙人通过合伙协议、合伙人会议的方式共同决定；执行机构为普通合伙人。《合伙企业法》第六十三条、八十二条；第六十七条2、有限责任公司：最高权力机构为全体股东组成的股东会；执行机构为董事会或执行董事。
六、出资流转1、有限合伙企业：（1）原则上，合伙人入伙、退伙及财产份额对外转让均须经全体合伙人一致同意；（2）合伙人在合伙企业的财产份额可以继承，有限合伙人资格一般可继承，普通合伙人资格一般不能继承；（3）合伙人可以在合伙协议中对合伙人的入伙、退伙、财产份额继承及对外转让作出更严格的规定。注：《合伙企业法》第二十条、六十条、七十三条、八十二条2、有限责任公司：（1）股东之间可以相互转让其全部或者部分股权；（2）股东对外转让股权应经其他股东过半数同意；（3）原则上，股东资格及股权均可以继承；（4）章程可以对股权转让做更严格规定。
七、对外投资1、有限合伙企业：可以向其他经济组织（如有限责任公司、股份有限公司、外商投资企业、合伙企业等）投资，原则上无限制。2009年11月20日之前，受政策限制，合伙企业在成为上市公司股东方面存在一定障碍。随着修订后的《证券登记结算管理办法》于2009年12月21日施行，这一障碍已不复存在。注：《合伙企业法》第二十条、六十条、七十三条、八十二条2、有限责任公司：可以向其他经济组织（如有限责任公司、股份有限公司、外商投资企业、合伙企业等）投资，原则上无限制，但须依照公司章程的规定，由董事会或者股东会决议；公司章程对投资的总额及单项投资的数额有限额规定的，不得超过规定的限额。
八、税收缴纳有限合伙企业与有限责任公司在税收缴纳方面的区别主要体现在所得税上：1、有限合伙企业：无需就合伙企业所得缴纳企业所得税，而是由合伙人就个人从合伙企业获取的利润分配缴纳所得税。注：《合伙企业法》第六条，《中华人民共和国企业所得税法》（以下简称《企业所得税法》）第一条第二款，《中华人民共和国个人所得税法》（以下简称《个人所得税法》）第二条第二项，《国务院关于个人独资企业和合伙企业征收所得税问题的通知》。2、有限责任公司：需要就企业所得缴纳企业所得税，股东还需要就个人从公司获取的利润分配缴纳所得税。注：《企业所得税法》）第一条第一款，《个人所得税法》第二条第七项因此，仅就所得税缴纳而言，合伙企业与有限责任公司相比，不存在双重税负。
九、利润分配1、有限合伙企业：原则上，合伙企业的利润分配按照合伙协议的约定办理；合伙协议未约定或者约定不明确的，由合伙人按照实缴出资比例分配；无法确定出资比例的，由合伙人平均分配。注：《合伙企业法》第三十三条、六十条、六十九条2、有限责任公司：原则上，股东按照实缴的出资比例分取红利；但是，全体股东约定不按照出资比例分取红利的除外。分配利润前要先提取法定公积金。注与有限责任公司相比，有限合伙企业在利润分配方面更能体现其“人合”的特点，更具有灵活性，且无提取法定公积金的强制性要求。
十、债务承担1、有限合伙企业：普通合伙人对合伙企业债务承担无限连带责任，有限合伙人以其认缴的出资额为限对合伙企业债务承担有限责任。注：《合伙企业法》第二条第三款2、有限责任公司：公司以其全部财产对公司的债务承担责任，股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任。
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