1、公安机关立案侦查的案件
除法律另有规定的，其他刑事案件应当一律由公安机关立案侦查。
法律另有规定的有：（1）由人民法院直接受理，不需要经过侦查的自诉案件；（2）由人民检察院直接立案侦查的案件；（3）由军队保卫部门负责侦查的军队内部发生的刑事案件；（4）由国家安全机关立案侦查的间谍案；（5）由监狱立案侦查的罪犯在监狱内犯罪的案件。
需要特别注意的是，涉税案件、破坏社会主义市场经济秩序罪由公安机关管辖，人民检察院不应受理；伪证罪、拒不执行判决、裁定罪由公安机关立案侦查，而不应由人民法院直接受理。另外，对于自诉案件的第二类，被害人向人民法院起诉后，人民法院认为证据不足、可由公安机关受理的，应当移送公安机关立案侦查。被害人向公安机关控告的，公安机关应当受理。
2、人民检察院立案侦查的案件
（1）贪污贿赂犯罪。是指修订后的刑法分则第八章规定的贪污贿赂罪和其他章节中明确规定按照刑法分则第八章贪污贿赂罪的规定定罪处罚的犯罪。
（2）国家工作人员的渎职犯罪。修订后的刑法已将渎职罪的主体修改为国家机关工作人员，人民检察院管辖的“渎职犯罪”，是指刑法分则第九章规定的渎职罪。
（3）国家机关工作人员利用职权实施的下列侵犯公民人身权利和民主权利的犯罪案件。
（4）国家机关工作人员利用职权实施的其他重大的犯罪案件，需要由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。
3、人民法院直接受理的刑事案件
自诉案件是指被害人及其法定代理人、近亲属，为追究被告人的刑事责任，而直接向人民法院提出诉讼的案件，人民法院立案后即进入审理阶段，而不需要经过公安机关或人民检察院立案侦查，也不需要人民检察院提起公诉。
1、立案。《刑事诉讼法》第一百零七条，“公安机关或者人民检察院发现犯罪事实或者犯罪嫌疑人，应当按照管辖范围，立案侦查。”公安机关要在7天内做出立案或者不立案的决定。
2、侦查。《刑事诉讼法》第一百一十三条，“公安机关对已经立案的刑事案件，应当进行侦查，收集、调取犯罪嫌疑人有罪或者无罪、罪轻或者罪重的证据材料。对现行犯或者重大嫌疑分子可以依法先行拘留，对符合逮捕条件的犯罪嫌疑人，应当依法逮捕。”
自诉案件，由人民法院直接受理。当事人如提起刑事自诉案件，一般由犯罪地的人民法院行使管辖权。刑事自诉案件的自诉人、被告人一方或者双方是港、澳、台居住的中国公民或者单位的，由犯罪地的基层人民法院审判。人民法院对于自诉案件进行审查后，按照下列情形分别处理：犯罪事实清楚，有足够证据的案件，应当开庭审判;缺乏罪证的自诉案件，如果自诉人提不出补充证据，应当说服自诉人撤回自诉，或者裁定驳回。自诉人经两次依法传唤，无正当理由拒不到庭的，或者未经法庭许可中途退庭的，按撤诉处理。
对于被害人有证据证明的轻微刑事案件（如轻伤、重婚、遗弃等），被害人无证据或者证据不充分的，人民法院应当说服其撤诉或者裁定驳回起诉。必要时，也可以将案件移送公安机关处理。
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