对于生产、销售伪劣农药、兽药、化肥、种子罪的处罚，《刑法》第一百四十七条根据其对生产造成的损失的大小，分为三个处罚档次：
《刑法》第一百四十七条：【生产、销售伪劣农药、兽药、化肥、种子罪】生产假农药、假兽药、假化肥，销售明知是假的或者失去使用效能的农药、兽药、化肥、种子，或者生产者、销售者以不合格的农药、兽药、化肥、种子冒充合格的农药、兽药、化肥、种子，使生产遭受较大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金；使生产遭受重大损失的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金；使生产遭受特别重大损失的，处七年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处销售金额百分之五十以上二倍以下罚金或者没收财产。
最高人民法院、最高人民检察院《关于办理生产、销售伪劣商品刑事案件具体应用法律若干问题的解释》第七条：刑法第一百四十七条规定的生产、销售伪劣农药、兽药、化肥、种子罪中“使生产遭受较大损失”，主要以二万元为起点；重大损失，主要以十万元为起点；特别重大损失，主要以五十万元为起点。
认定本罪要注意与破坏生产经营罪的区别。其主要是：
１、本罪一般是出于非法牟利的目的，后罪则是出于泄愤报复或者其他个人目的；
２、本罪在客观方面一现为生产、销售伪劣农药、兽药、化肥、种子并使生产遭受较大损失的行为。行为与结果之间并非直接相连，而是通过消费者购买并使之罪，依其情节分别承担刑事责任。
不法分子销售伪劣农药的行为，必须对他人造成了严重的侵权行为，严重的可以导致农作物的严重损失，国家也出台了一系列的规定，来对相关事项进行明确，如果涉及到上述犯罪事实的，应当依据实际来进行判决处理。
生产销售假冒伪劣农药触犯了《刑法》。
我国《刑法》规定生产假农药、假兽药、假化肥，销售明知是假的或者失去使用效能的农药、兽药、化肥、种子，或者生产者、销售者以不合格的农药、兽药、化肥、种子冒充合格的农药、兽药、化肥、种子，使生产遭受较大损失的，会判刑。
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