农村自建房拆迁的补偿标准是当地政府规定的。
征地补偿标准是指在市镇行政区的土地根据政府总体规划确定的用地范围内，依据土地类型、土地年产值、土地区位登记、农用地等级、人均耕地数量、土地供求关系、当地经济发展水平和城镇居民最低生活水平保障等因素，再依据片区划分用于征地补偿综合计算的标准。
农村自建房有房产证，根据我国法律的规定，房屋这类财产只有办理了登记，领取了房产证，才能证明你是真正的房屋所有人。因此，农村建房也是有房产证的。农村办理房产证，首先需要满足一定的条件。由于农村建房的宅基地需要通过审批，因此，农村房屋房产证的办理不同于城市房屋的先买房后办证。而是需要先提出申请，通过审批后，才可以建房并领取房产证。
１、农村村民建住宅，首先向集体经济组织提出申请或城管部门提出申请；
２、村集体经济组织对申请建房户在醒目的地方进行张榜公示（15个工作日以上）；
３、国土资源管理所及镇社会事务办公室到实地对申请人是否符合条件，拟用地是否符合规划等进行初审；
４、公布期满无异议后，将符合“一户一基”条件的用地户按规定报乡镇人民政府审核后，报县人民政府审批（占用农用地的按规定报市政府办理农用地转用审批手续）。
５、宅基地批准后，国土资源所及镇社会事务办公室到实地批放宅基地，并发放选址意见书，规划许可证，施工许可证（“一书两证”）。
６、村民住宅建成后，国土资源所到实地检查是否按批准面积和要求使用土地，对符合要求的建房户核发集体土地使用证书。
７、村民凭土地使用证及规划许可证申请办理房屋所有权证。
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