棚户区改造按照政府主导、市场运作的原则实施。政府除了鼓励地方实行财政补贴、税费减免、土地出让收益返还等优惠政策外，还允许在改造项目里，配套建设一定比例商业服务设施和商品住房，支持让渡部分政府收益，吸引开发企业参与棚户区改造，即使得原棚户区居民能享受到更好的公共服务，还可以缓解政府筹资压力，提高改造效率。棚户区如果有院子的话，具体要看院子的面积有没有算在产权证以内。如果算在产权面积以内，是给予赔偿的。如果没有算在产权面积以内，原则上不予赔偿。但可以根据实际情况与拆迁办沟通，争取最大利益。
符合城市棚户区条件且可单独规划建设的单位住宅生活区可纳入城市棚户区改造计划。棚户区改造拆迁安置实行货币补偿与产权调换相结合，由被拆迁人自愿选择。对拆迁产权面积小于36平方米且在同一城区无其他自有房屋的，安置时补齐36平方米，不结算差价，被拆迁户原则上在安置房最小户型中安置；对超出36平方米的部分实行阶梯式价格结算，36至50平方米的部分按成本价结算，超过50平方米的部分按市场价结算。
被拆迁人选择产权调换的，对原拆迁面积部分免征契税；被拆迁人以补偿的货币购买商品住房或二手房的，仅对其超出补偿金额差额部分征收契税；对购买商品住房、二手房作为拆迁安置房的，等面积部分免征买方契税。
1、土地储备中心对危房棚户区土地实行收购，以净出让方式供地。净地出让后获得的出让收益，扣除按规定缴省的费用后，专项用于支付银行贷款本息和毛地收购资的周转以及危房棚户区安置房建设。
2、安置房住宅用地实行土地行政划拨，对改造后的房屋纳入产权产籍管理，办理商品房房照。商服用地实租赁供地。
3、安置房建设项目行政事业性收费（以费还贷项目除外）全免，经营、服务性收费按最低限下浮50%收取（项明细附后）。
4、安置房房屋拆迁补偿契税先缴后返；对安置房住宅上靠标准户型增加的建筑面积部分，营业税等税种由地方税务部门向省申请暂缓缴纳。
《国有土地上房屋征收与补偿条例》第十七条作出房屋征收决定的市、县级人民政府对被征收人给予的补偿包括：
1、被征收房屋价值的补偿；
2、因征收房屋造成的搬迁、临时安置的补偿；
3、因征收房屋造成的停产停业损失的补偿。市、县级人民政府应当制定补助和奖励办法，对被征收人给予补助和奖励。
第十八条征收个人住宅，被征收人符合住房保障条件的，作出房屋征收决定的市、县级人民政府应当优先给予住房保障。具体办法由省、自治区、直辖市制定。
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