票据贴现业务的风险包括信用风险、操作风险和市场风险。诈骗手法主要有伪造变造票据、内外勾结实施诈骗等，致使票据各方的合法利益受到了损害，严重扭曲了票据的功能，影响了票据业务的规范开展。
(一)建立健全票据业务内控机制
(1)细化贴现业务岗位责任制。一是对贴现业务流程中各岗位人员职责进行细化，明确各岗位每项职责的具体内容，统一审查要求、标准、方法;二是明确贴现业务不相容岗位、不相容职责;三是明确各岗位人员在流程中所承担责任的大小。
(2)建立贴现业务日常检查制度。贴现经营机构内部以岗位责任制为基础，实行后一环节对前一环节审查的事项进行核查，机构负责人不定期抽查，对违规行为追究经办人员责任。
(3)加大对专业人员的培养。票据真实性审查主要依靠票据审查人员的专业技能和责任心，票据审查人员技能的提高有赖于培训和日常的积累，要加强票据审查人员的培养，确保票据审查人员的相对稳定性。
(二)严格防范关键环节风险
实行不相容岗位分离，信贷审查岗、票据审查岗和审批岗之间互相不得兼岗。
(1)票据伪造变造风险。验票环节：票据审查人员必须经培训考核通过后方能上岗，票据审查实行双人审查，票据初审岗、票据复审岗要全面掌握票据防伪暗记，对拟贴现票据进行严格审查，并配备必要的票据鉴别仪器。查询环节：贴现前必须向承兑行查询，查询全部通过人行大额支付系统，实地查询仅作为补充方式，且必须客户经理和审票人员双人查询;对影响票据到期解付的事项应向承兑行发出查询，得到承兑行确认回复后办理。
(2)贸易背景真实性风险。贸易背景真实性审查实行双人审查，相关材料复印件必须与原件核对无误。贴现申请人及其直接前手与合同中的供需双方和发票购销双方名称相符;汇票的金额与合同及发票金额之间存在逻辑合理性，汇票金额不能大于合同金额和发票金额;汇票的签发日期、贴现日期与合同签订日期及发票开票日期之间存在逻辑合理性。合同：对新客户进行贴前调查，分析客户办理票据业务的真实需求，与业务总量对应的交易总量要与企业基本需求一致，所签购销合同符合其经营规律;增值税发票：严格审查增值税发票的真实性，发票的商品名称、数量、单价与合同匹配，增值税发票全部通过税务网站进行核查，也可采取电话、传真、实地调查交易对手等方式进行核实，必要时到当地税务部门核实相关发票信息，防止客户利用伪造、变造发票、先贴后废、旧票新用、一票多用、虚假合同等方式办理票据业务。
(3)公示催告风险。票据审查人员要通过人民法院报搜集公示催告信息，将是否公示催告列入票据查询的内容之一，贴现后通过人行大额支付系统向承兑行发出已贴现通知，保留已贴现汇票完整背书复印件，在票据遗失或被公示催告后及时按规定申报权利。
(4)已贴现票据的交接、保管、托收风险。一是交接和保管风险。建立客户经理、审查人员、保管人员的交接登记制度。已贴现票据必须背书至贴现经营机构后，寄金库或入保险柜保管，实行双人负责。保险柜安放地点须配备守卫人员、电子监控或其他安保措施。票据保管人员负责已贴现汇票的登记、入库保管工作，并定期查库、核对，保证账实相符。二是委托收款风险。委托收款人员匡算邮程，按《支付结算办法》有关规定办理委托收款手续。异地汇票必须通过特快专递方式办理委托收款，委托收款人员通过邮局网站跟踪邮递环节、及时与承兑行联系确认是否按时付款，退回票据的邮件要严格交接，以免遗失。
