由人民法院决定。
公安机关发现精神病人符合强制医疗条件的，应当写出强制医疗意见书，移送人民检察院。对于公安机关移送的或者在审查起诉过程中发现的精神病人符合强制医疗条件的，人民检察院应当向人民法院提出强制医疗的申请。人民法院在审理案件过程中发现被告人符合强制医疗条件的，可以作出强制医疗的决定。
对实施暴力行为的精神病人，在人民法院决定强制医疗前，公安机关可以采取临时的保护性约束措施。
刑事诉讼法修订前，公安机关决定强制医疗的程序不透明，连听证都无需举行。修改后的《刑事诉讼法》第２８６条规定：“人民法院受理强制医疗的申请后，应当组成合议庭进行审理。人民法院审理强制医疗案件，应当通知被申请人或者被告人的法定代理人到场。被申请人或者被告人没有委托诉讼代理人的，人民法院应当通知法律援助机构指派律师为其提供法律帮助。”
由于强制医疗的适用直接关系到行为人的人身自由和判断行为人是否符合２８４条规定的三个要件非常复杂，所以由合议庭的审判组织形式更有利于案件质量的保证。本条第２款规定了强制医疗程序的告知程序和“强制代理制度”，因为被申请人或被告人由于患有精神疾病、缺乏诉讼技能甚至人身受到限制，很有可能不能有效参与到审理，维护自己的合法权利，所以告知程序和“强制代理制度”是必要的程序设计和“尊重和保障人权”具体的程序体现。
为了确定被申请人是否符合强制医疗的条件，应该进行法庭调查和法庭辩论。法庭审理应该查明：
１）是否发生过刑法所禁止的行为，行为的时间、地点、方法和其他情况，是否属于暴力行为，是否危害到公共安全或者严重危害公民人身自由；
２）被申请人是否实施了该行为；
３）被申请人过去是否患有精神病，实施该行为时精神病的程度和性质，是否处于无刑事责任能力状态；
４）被申请人的精神病是否可能使其继续危害社会；
５）是否应该适用强制医疗措施和应该适用何种强制医疗措施。
《中华人民共和国刑事诉讼法》第二百八十四条规定：实施暴力行为，危害公共安全或者严重危害公民人身安全，经法定程序鉴定依法不负刑事责任的精神病人，有继续危害社会可能的，可以予以强制医疗。强制医疗的决定机关为人民法院，执行机关为公安机关。具体而言，人民法院负责强制医疗决定书的作出，公安机关负责强制执行。
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