1、医患双方协商一致共同向市医学会提起鉴定申请，或患方向医疗行政部门投诉由医疗行政部门移交医学会鉴定，或由人民法院根据当事人申请委托医学会鉴定。
2、医学会受理鉴定委托。
3、由申请一方或双方交纳鉴定费。
4、医学会通知双方提交陈述书、答辩书及鉴定所需材料。
5、查看相关专科专家名录并选出需回避的专家。
6、对双方认可的专家随机编号，由医患双方及医学会随机抽号组成专家鉴定组。
7、召开鉴定会，医患双方按先患方后医方的顺序各陈述(答辩)15分钟、专家提问、退庭。
8、专家讨论，出具医鉴结论报告。
9、若不服鉴定报告，向省医鉴会提起再次鉴定。
对于首次医疗鉴定结论不服的可以再次申请医疗鉴定，依据《医疗事故处理条例》第三十九条规定，卫生行政部门应当自收到医疗事故争议处理申请之日起10日内进行审查，作出是否受理的决定。对符合本条例规定，予以受理，需要进行医疗事故技术鉴定的，应当自作出受理决定之日起5日内将有关材料交由负责医疗事故技术鉴定工作的医学会组织鉴定并书面通知申请人；对不符合本条例规定，不予受理的，应当书面通知申请人并说明理由。当事人对首次医疗事故技术鉴定结论有异议，申请再次鉴定的，卫生行政部门应当自收到申请之日起7日内交由省、自治区、直辖市地方医学会组织再次鉴定。
1、当事人一方直接向医学会提出鉴定申请的；医学会不予受理医疗事故鉴定。
2、医疗事故争议涉及多个医疗机构，其中一所医疗机构所在地的医学会已经受理的医疗事故鉴定的；医学会不会再受理医疗事故鉴定的申请。
不但医疗事故鉴定如此规定，就连法院受理案件也是“同一案件不再受理”的原则。这不但是一个法律实务原则，也是避免不必要纠纷的工作规定。
3、如果医疗事故争议已经人民法院调解达成协议或判决的；医疗事故鉴定机构将不再受理医疗事故鉴定申请。
4、如果患者及其家属已经向人民法院提起诉讼的，医疗事故鉴定机构将不再受理医疗事故鉴定的申请。
5、如果医疗纠纷的发生，是由于医疗机构非法行医造成患者身体健康损害的，医疗事故鉴定机构是不受理医疗事故鉴定申请的。
6、卫生部规定的其他情形。
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