在发生医疗纠纷的地方上只要有卫生行政部门卫生局的，有医学会的，就可以组织医疗事故鉴定专家组，进行医疗事故鉴定。但是，当地未必就有临床医疗伤害的司法鉴定中心。由于司法鉴定机构的要求比较高、其性质属于社会中介组织。所以，当地是否有司法鉴定机构都是不一定的。
由于司法鉴定机构一般是不接受患者及其家属的单方委托的，而在司法实践中很少有医疗机构与患者协商一致，共同委托司法机构进行鉴定的。所以，在通常情况下，更多的是看到由法院委托司法鉴定的情况。
如果是法院委托鉴定的，仍然是按照就近原则，如果本地司法鉴定机构有能力进行临床司法鉴定的，应当委托其进行鉴定；如果本地没有司法鉴定的能力需要委托外地的双方鉴定机构鉴定的，经法官同意，才可以委托外地鉴定机构鉴定。
就目前我国司法鉴定机构的情况看，通常情况下，在一个省、自治区、直辖市的范围内，都有相应的鉴定机构，也具备一般医疗纠纷的司法鉴定能力。所以，在诉讼之初就提出到大城市做司法鉴定的往往不会被接受。异地鉴定(同省不同市)被接受已经很不容易了。一下子要求到遥远的北京、上海去鉴定恐怕是不太现实的。
由于我国医疗体制的问题，往往在一个地方，只有一家最大、最好的医疗机构，该医疗机构的对其他相关机构的影响都是不同程度的存在的。越是在边远地区、越是在经济不发达地区，这种现象更为严重。因此，就本地的司法鉴定机构的鉴定，往往患者及其家属存在比较多的顾虑。
由于我国法规中没有规定“异地鉴定”的规则，而是以“本地鉴定”为原则，因此，地方上的“司法腐败”、“猫鼠同乐”的情况是现实存在的。但是，即便是这样，由于在诉讼程序中，司法鉴定的委托是由法官指定的，因此，在本地鉴定的情况还是占绝大多数的。从我国法规的设计上看，这是存在问题的，立法机构为维护法律程序是“客观、公正性”应当在程序设计上考虑到现实情况的存在，也应当给医疗纠纷当事人更多的自由选择权。在法律程序的设计上“消除”当事人的疑虑。用“透明”“完全可见”的方式，分清是非、区分责任。避免“暗箱操作”和司法腐败。
