国家机关及其工作人员执法、司法时在事实认定、法律适用、法定程序三方面任何一个方面违法，都将被确认行为违法。那么因越权或违反法定程序的违法是否必然引起国家赔偿呢?笔者认为不一定。越权或程序违法直接侵害的是行政或司法程序制度，可能侵害相对人程序上受保护的权益，但不一定侵害其实体权益，不侵害实体权益就不发生国家赔偿责任。而即使违法行为造成损害，也还要看其权利是否受法律保护。如某诊所从无药品生产经营许可证的企业购进100盒“消炎颗粒”，药品监督管理局扣押、没收了该药品，某诊所不服提起诉讼。法院审理确认药品监督管理局扣押程序违法，但也驳回了诊所返还药品的赔偿请求，因为依据《药品管理法》第80条之规定，该扣押药品应予没收，诊所该实体权益不受法律保护，也就不能返还。
在合法实体权益问题上必须有一个正确的判断。如孙某对县公安局拘留其10天的行为不服提起诉讼，法院审理认定该拘留行为程序违法，故依法撤销了原拘留决定。有人认为，根据孙某的违法事实判断，对其拘留并不为过，虽说程序违法，但不能认定侵犯其合法权益。笔者认为，人身权是当然的合法权益，不存在非法权益问题。依据《国家赔偿法》第3条第(一)项规定，孙某有取得国家赔偿的权利。
