合同中的保密条款是涉及持有商业秘密的权利人在作为合同的当事人时，以具体的保密条款来约束相对方在履行合同过程中以及合同履行后的一定时期内，务必要遵守的保密义务，采取必要的保密措施，限定保密人员的范围，防止具有经济利益的商业秘密因履行合同而泄密，造成权利人的经济损失。

由此可以看出，合同的保密条款是合同文本中非常重要的一节，无论是在主合同中约定商业秘密的保密条款，还是另行制定保密合同，都是对商业秘密权利人的一种保护措施。

在制定保密条款时，要从以下四个环节着手起草相关的条款：

一、限定保密主体。

凡是因履行合同过程中，能够接触到商业秘密的人，都应当是负有保密义务的主体。

在合同履行过程中，不仅仅是限定合同主体一方的直接经办人承担保密义务，而且涉及到开发、利用商业秘密的职工、接触商业秘密的辅助人员（如复印、保管、摘抄商业秘密资料）以及相关了解商业秘密的其他人员，都要负有保密义务。此时，要求合同的相对方，必须要建立一套切实可行的规章制度，采取严格的保密措施，加强对涉密人员的管理，防止在合同履行过程，造成商业秘密泄露。这既是避免权利人的经济损失，同时也是防止获取和利用商业秘密的一方因履行合同不当承担违约责任。

二、约定违约责任。

由于商业秘密是能够给权利人带来经济利益的交易信息、专有技术或者其他经过权利人采取保密措施的信息。因此，在合同履行过程中，如果合同的相对方没有采取必要的保密措施造成泄密的。此时，合同中必须设定必要的违约责任条款，起到对负有保密义务一方督促和警示的作用。

由于权利人所持有的商业秘密，其经济利益往往无法衡量，如果因为负有保密义务的一方违约后，如何适用违约罚则，对权利人的保护至关重要。

因此，建议在制定因泄密导致的违约行为时，既要约定违约金，同时也要求泄密一方赔偿实际损失，且实际损失包括履行本合同所产生的可得利益，以及商业秘密的市场价值等损失，这些损失项目务必要在合同中详细予以约定，以作为发生违约行为时的适用依据，将权利人的损失降至最低，如追究对方违约行为时，可以约定维权的投入也是损失的组成部分，包括诉讼费、调查费、公证费和律师费等损失。

三、可以另行订立保密合同。

在主合同需要报备、联合投标或者其他共同投资合作，合同内容需要对外公开的情况下，双方可以另行订立保密合同，将商业秘密涉及的内容通过订立保密合同，约定义务人应当采取的保密措施等内容，防止泄密。

在订立保密合同时，要明确约定，如果主合同无效、解除或者履行终止等无法履行的情形，保密合同仍然有效。

之所以如此约定，目的就是要充分保护商业秘密的内容不因主合同无法履行而导致泄密，义务人仍需承担保密义务。

四、保密期限要合理。

保密期限涉及到负有保密义务的一方当事人合理承受能力以及权利人的权利界限。

保密期限可以延长至主合同履行完毕后的一定时间，根据商业秘密的性质以及市场的变化等情况确定，既不能过短，也不能过长。

如果保密期限过短，会导致保密义务人在期限届满后，将商业秘密推向公开市场而获利，由此无需承担责任，直接导致权利人的经济利益受损；而期限过长，也会导致负有保密义务人承担过重的合同责任，为此将付出较重的经济成本，如投入大量的人力、物力，建立保密制度和保密措施，防止泄密，这些行为都是需要投入资金的。

如果商业秘密已经公开，为公众所知晓，那么，在合同中也要约定，负有保密义务的一方由此将终止履行保密义务。

在订立保密条款或者保密合同时，双方一定要认真探讨商业秘密采取保密措施的可行性。如利用专有秘密技术生产的产品，在推向市场后，如果能够通过反向工程破解其中的核心技术，那么，就没有必要采取保密措施了。完全可以由权利人通过申请专利，在获专利权后，双方签订专利许可合同，也可以起到合作的目的。

由于涉及保密条款的撰写是极为复杂、疑难的法律实务，建议合同当事人听取律师的意见，并在必要的情况下，由律师协助审查和修改关于保密条款的具体内容，防止条款制定上出现瑕疵，导致己方的利益受损，将法律风险降至最低。