福州市属公立医院：

1、福州市第一医院

2、福州市第二医院

3、福州市肺科医院

4、福州市传染病医院

5、福州市皮肤病院

6、福州市中医院

7、福州市妇幼保健院

8、福州儿童医院

9、福州市第六医院

10、福州市第七医院

11、福州市第八医院

12、福建省闽清精神病防治院

13、福州神经精神病防治医院

福州市属民营医院：

1、福州眼科医院

2、福州神康医院

3、福州福兴妇产医院

4、福州福兴妇产医院东院

5、福州东南眼科医院（金山新院）

6、福州东南眼科医院

7、福州和睦佳妇产医院

8、福州现代妇产医院

9、福州东南口腔医院

10、福州中德骨科医院

医疗机构的主管部门是福州市卫生健康委员会。