1、直接支付至承包人的指定账户。

　　发包人将工程款支付至承包人的指定账户，无论是转账、现金汇款还是使用票据，对双方来说都无疑是避免纠纷的最有效方式。即使付款或收款的凭证不慎遗失，任何一方都可以到银行查询交易记录完成举证，法院也可以通过调查取证查清付款的详细信息

　　2、支付给承包人的有关人员。

　　发包人将工程款直接支付给实际施工人的情形较多。除了实际施工人以外，承包人的财务人员、现场负责人或委托授权的其他人往往也会收取工程款。

　　3、支付给特定的第三方

　　在履行合同过程中，发包人需要将一部分工程款支付给第三方，而承包人对此予以认可或应当认可的，同样具有法律上的效力。

　　二、如何索要工程款

　　1、考虑由合同双方达成协议补充，以确定支付工程款的期限。

　　在合同对支付工程款期限问题约定不明时，首先应当尊重当事人就该问题达成的补充协议。如果当事人就支付工程款期限问题达成补充协议，则补充协议也构成合同的组成部分，承包人可以按照补充协议约定的期限主张发包人支付工程款。

2、不能达成补充协议的，结合解释合同其他条款确定支付工程款的期限。

　　根据其他条款补充支付期限条款的内容，应当从合同的文意出发，尽可能尊重合同的本意，结合相关条款，使得合同内容逐步具体和明确。施工合同中关于施工进度、工期等条款与工程款支付期限联系最为密切，除了结合《专用条款》中关于施工进度、工期等约定内容，还要结合《通用条款》中约定的内容。

　　根据《通用条款》第二十五条、二十六条约定，可以顺利确定支付工程款的期限：在工程施工过程中，承包人若一直按照专用条款约定的时间，向发包人提交已完工程量的报告。发包人应在确认计量结果后14天内向承包人支付工程款(进度款)。