毕业生违反三方协议用人单位主张违约金时，如果认为三方的违约金过高，毕业生可以适用最高人民法院关于适用《中华人民共和国合同法》若干问题的解释(二)(2009年2月9日最高人民法院审判委员会第1462次会议通过 法释〔2009〕5号)第二十九条：当事人主张约定的违约金过高请求予以适当减少的，人民法院应当以实际损失为基础，兼顾合同的履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等综合因素，根据公平原则和诚实信用原则予以衡量，并作出裁决。当事人约定的违约金超过造成损失的百分之三十的，一般可以认定为合同法第一百一十四条第二款规定的“过分高于造成的损失”。 那么你可以测算你所签订的这个企业招一名员工的成本的130%赔偿，超过这个标准应当算过高。
三、毕业生如何规避签订三方协议的法律风险
1.正确区分协议期、合同期、试用期、实习期、见习期、服务期和学徒期这七个时期，这直接关系到毕业生的权益维护。
协议期：是从毕业生与用人单位签订就业协议书开始，一直持续到签订劳动合同之后或者双方终止协议为止。在协议期内，双方已经确定了工作意向，但未建立正式的劳动关系。
合同期：是用人单位与劳动者协商，在劳动合同中约定双方建立劳动关系的具体期限。
试用期：是用人单位和劳动者为了相互了解、相互选择而约定的考察期。根据有关规定，试用期与劳动合同的期限应一致。
实习期：实习期分为两类。一类是，实习人员根据法律法规的要求在单位通过实践进行一定专业训练的期限。实习期一般为一年。这类人员一般与单位都建立劳动关系，实习目的在于从工作中增强从事这些专业工作的熟练度，以便将来能够较独立地从事这样的职业。如律师、医师等。另一类是实习人员出于教学需要在单位进行社会实践的行为，如大学生的毕业实习。
见习期：是计划经济体制下，针对大、中专毕业生新分配到用人单位工作，需要进行业务适应及考核的一种制度。合同中约定了见习期的，不再另行约定试用期，毕业生见习期为一般为一年，自报到之日起计算。
服务期：是劳动者因接受用人单位给予的特殊待遇而承诺必须为用人单位服务的期限。根据相关规定，用人单位只能与三类人员签订服务期协议，一是用人单位花费大量费用招聘的人员；二是投入大额资金进行特殊培训的人员；三是用人单位为其提供特殊待遇的人员（如住房待遇、通讯设备、交通工具的提供等）。
学徒期：是针对某些工作岗位的新招工人，为了让其熟悉业务、提高工作技能的一种培训、学习期限。

2.就业协议在毕业生到单位报到、用人单位正式接收后自行终止。三方协议的效力仅在毕业生到用人单位报到后起算一个月内有效，一个月后毕业生和用人单位的劳动关系适用劳动合同法的规定。如果适用劳动合同法，大家都知道牢牢守住两个条款：二十二条和二十三条两兄弟第二十二条：用人单位为劳动者提供专项培训费用，对其进行专业技术培训的，可以与该劳动者订立协议，约定服务期。劳动者违反服务期约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。违约金的数额不得超过用人单位提供的培训费用。用人单位要求劳动者支付的违约金不得超过服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用。第二十三条：用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。除此之外劳动合同中不得约定任何违约金和惩罚性违约金。还是请大家记住无论三方约定了多少违约金，报道后1个月，三方协议已近完成它的使命。那么需要注意的是如果单位事先在三方协议中有其他约定的承诺，如单位提供的非法定福利，如住房补贴等，这些约定最好是书面的，非口头的承诺，最好另外以合同的形势或者其他书面的形式约定。那么在签订正式的合同中才能保障你的合法权益。