当在医疗期内的员工非因工致残或患有难以治疗的疾病，彻底终结治疗，不能从事原工作，也不能从事用人单位另行安排的工作的，终止劳动关系，办理退休、退职手续，享受退休、退职待遇；被鉴定为五至十级的，医疗期内不得解除劳动合同，劳动合同延续至医疗期满。 当医疗期满时，员工治疗仍未结束，续签劳动合同的前提是员工可以履行新的劳动合同，但员工还在治疗当中，不可能履行新一期的劳动合同，所以这时公司可以选择不续签。
根据《劳动合同法》第46条的规定，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位解除劳动合同的，应当向劳动者支付经济补偿。第47条规定，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满1年支付1个月工资的标准向劳动者支付。同时，根据《劳动合同法实施条例》第27条的规定：劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准的，按照当地最低工资标准计算。劳动者工作不满12个月的，按照实际工作的月数计算平均工资。
工伤医疗期满后不来上班，可以调整岗位，但是不能辞退劳动因为工伤员工本身的特殊性，劳动法对其权益有着特别的保护规定。对于一至六级工伤员工，用人单位应保留劳动关系，除非工伤职工本人提出解除或者终止劳动合同，用人单位不得单方面解除或终止劳动合同(五至六级工伤员工严重违纪除外)。
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