当公司违法解除怀孕期间的员工劳动合同，员工有两种维权方案：
第一种，员工可以要求继续履行合同，并且支付工资损失到合同再继续履行时。若在案件处理过程中劳动合同到期，则仲裁或法院会撤消用人单位的解除劳动合同决定，认定双方劳动合同终止，并会要求用人单位支付到劳动合同终止之日的工资和经济补偿金（该补偿金应为每工作一年支付一个月的经济补偿金，０８以前工作的年限不计算，从０８年开始计算）。
第二种，根据《劳动合同法》第四十二条第规定：
女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。
“不得”就是强制性规定，不可违反。如用人单位违法解除怀孕女工的劳动合同，劳动者要求继续履行劳动合同的，用人单位应该撤销解除劳动合同的决定；
劳动者不愿意继续在本单位工作的，按《劳动合同法》第八十七条规定，用人单位应当按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
若员工不要求继续履行合同，要求用人单位支付违法解除的赔偿金，用人单位则应按每工作一年支付两个月工资的标准支付。至于员工选择那一种方式，取决于员工未履行完的劳动合同期的长短及在用人单位的工作年限长短，若员工未履行完的合同期较长，但工作年限较短，第一种方式能较好维护权益。若工作年限较长，因违法解除按工作年限的双倍赔偿，第二种方式综合下来能较好维护权益。
首先，在员工怀孕期间因企业经营不善而倒闭，由企业和员工协商解除劳动合同的情况下，对员工的三期（孕期、产期、哺乳期）期间的赔付项目规定的不是很明确；
１、依据有关规定，产期期间的工资必须全额支付；
２、孕期和哺乳期期间的赔付的具体数额，由公司和您具体协商后确定；
３、经济补偿金部分，依据您在该公司工作的年限来支付，每满一年支付一个月，六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向您支付半个月工资的经济补偿。
我国劳动法规定了对怀孕女职工的特殊保护。该法第六十一条规定：不得安排女职工在怀孕期间从事国家规定的第三级体力劳动强度的劳动和孕期禁忌从事的活动。对怀孕七个月以上的女职工，不得安排其延长工作时间和夜班劳动。
同时，根据《劳动合同法》的规定，用人单位不能单方解除与怀孕女工的劳动合同。
但是，如果是怀孕女职工主动提出解除劳动合同，那么根据法律规定，用人单位没有支付经济补偿金的义务。
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