中外合资企业属于外商投资企业，按外商投资企业享受税收优惠。外商独资企业享受的税收优惠主要体现在增值税和企业所得税方面。
增值税方面，有采购国产设备退增值税的税收优惠。国税发[1999]171号文规定，外商投资企业在核定退税的投资总额内，采购符合《外商投资产业指导目录》（鼓励类和限制乙类）以及《当前国家重点鼓励发展的产业、产品和技术》投资项目的国产设备，凡在1999年9月1日以后购进的，可全额退还国产设备增值税。
企业所得税方面，可按规定享受定期减免优惠、地区税率优惠、购买国产设备投资抵免企业所得税、追加投资优惠、再投资退税、技术开发费加计扣除等税收优惠。
定期减免优惠，如《外商投资企业和外国企业所得税法》第八条规定：“对生产性外商投资企业，经营期在十年以上的，从开始获利的年度起，第一年和第二年免征企业所得税，第三年至第五年减半征收企业所得税，但是属于石油、天然气、稀有金属、贵重金属等资源开采项目的，由国务院另行规定。外商投资企业实际经营期不满十年的，应当补缴已免征、减征的企业所得税税款。”
地区税率优惠，如《外商投资企业和外国企业所得税法》第七条规定：“设在经济特区的外商投资企业，在经济特区设立机构、场所从事生产、经营的外国企业和设在经济技术开发区的生产性外商投资企业，减按百分之十五的税率征收企业所得税。
设在沿海经济开放区和经济特区、经济技术开发区所在城市的老市区的生产性外商投资企业，减按百分之二十四的税率征收企业所得税。
设在沿海经济开放区和经济特区、经济技术开发区所在城市的老市区或者设在国务院规定的其他地区的外商投资企业，属于能源、交通、港口、码头或者国家鼓励的其他项目的，可以减按百分之十五的税率征收企业所得税，具体办法由国务院规定。“
购买国产设备投资抵免企业所得税，财税字[2000]49号文规定：“凡在我国境内设立的外商投资企业，在投资总额内购买的国产设备，对符合《国务院关于调整进口设备税收政策的通知》（国发〔1997〕37号）中规定的《外商投资产业指导目录》鼓励类、限制乙类的投资项目，除国发〔1997〕37号规定的《外商投资项目不予免税的进口商品目录》外，其购买国产设备投资的40％可从购置设备当年比前一年新增的企业所得税中抵免。”
追加投资优惠，财税[2002]56号文规定：“从事经国务院批准的《外商投资产业指导目录》中的鼓励类项目的外商投资企业，凡符合以下条件之一的，其投资者在原合同以外追加投资项目所取得的所得，可单独计算并享受税法第八条第一、二款所规定的企业所得税定期减免优惠：（一）追加投资形成的新增注册资本额达到或超过6000万美元的；（二）追加投资形成的新增注册资本额达到或超过1500万美元，且达到或超过企业原注册资本50%的。”
再投资退税，《外商投资企业和外国企业所得税法》第十条规定：“外商投资企业的外国投资者，将从企业取得的利润直接再投资于该企业，增加注册资本，或者作为资本投资开办其他外商投资企业，经营期不少于五年的，经投资者申请，税务机关批准，退还其再投资部分已缴纳所得税的百分之四十税款，国务院另有优惠规定的，依照国务院的规定办理；再投资不满五年撤出的，应当缴回已退的税款。”
技术开发费加计扣除，国税发[1999]173号文规定：“外商投资企业技术开发费比上年增长10％以上（含10％）的，经税务机关批准，允许再按技术开发费实际发生额的50％抵扣当年度的应纳税所得额。”
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个人所得税方面，主要是针对外籍个人的优惠。如财税字[1994]020号文规定，外籍个人从外商投资企业取得的股息、红利所得免缴个人所得税。
