审计单位与业主一般是按结算造价的比例支付审计费用，这个系数根据项目不同系数也不同，可以是2％或3％。另外超出审核造价后5％部分按5％的审计费由施工方支付。
工程审计包括两大类型：工程造价审计和竣工财务决算审计。
造价审计一般是对单项、单位工程的造价进行审核，其审计过程与乙方的决算编制过程基本相同，即按照工程量套定额。这由造价工程师完成。
对于建设单位来说，由于造价审计只是审核单项、单位工程的合同造价，一个建设项目的总的支出是由很多单项、单位工程组成的，而且还有很多支出比如前期开发费用、工程管理杂费等是不需要造价审计的，所以还要有一个竣工财务决算审计，就是将造价工程师审定的，和未经造价工程师审核的所有支出加在一起，审查其是否有不合理支出，是否有挤占建设成本和计划外建设项目的现象等，来确定一个建设项目的总的造价。这由注册会计师完成。
网友：工程审计有什么要求？
律师：1、应在建设项目正式立项时，即将其纳入审计视野，关注其各项前期准备工作。正式进点时间可安排在即将正式开工前。
2、审计组应在项目现场设立办公场所，与被审计单位建立定期例会制度，参加被审计单位的重要例会，及时了解、掌握项目有关情况，提出审计意见，并且作好会议记录。
3、对中标合同价进行控制，不允许施工现场随意变更设计、增项、减项、扩大工程造价；对工程用料，隐蔽工程进行质量和数量监控，防止施工单位偷工减料或以次充好。所有隐蔽工程除应有甲方施工现场管理人员、监理人员签字外，还必须有跟踪审计人员签字。
4、审计组成员应经常深入施工现场，掌握工程进展、变更等真实情况，了解工程建设中涉及的有关技术问题，熟悉工程计量规则及有关费用的测算办法，并且作好相关记录。对各参建单位（包括建设项目相关单位）实际完成的工作内容、工作数量、工作质量进行核定，开具核定单。
5、审计组应根据跟踪审计实施方案的要求，要求被审计单位按照审计组规定的时间和方法报送工程结算资料，并及时确定审计结果。
6、审计组应建立《跟踪审计项目台账》，由主审人员负责及时登记审计时间、工作纪实（包括工作内容、审计事实、发现问题、审计意见、整改情况、审计成果）。台帐要注重反映量化成果，成为反映跟踪审计全貌的工作日志。
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