根据我国农业发展的实际情况以及20多年来农业结构调整的实践经验，在新的发展阶段，农业结构调整应有新思路、新办法、新举措。
1、加强农村合作经济组织建设，帮助农民了解市场。在继续完善双层经营体制的基础上，积极扶持农民专业合作社、专业协会等农民合作经济组织的发展。积极扶持农村个体运销大户，培育民间运销组织。积极发展“订单农业”，有条件的地方要发展生产基地与连锁经营、配送中心相结合的新型流通方式。总之，要通过各种方式解决农户分散经营与大市场的矛盾，帮助千家万户了解市场，按照市场需求来调整农业生产结构。
2、加大对“龙头”企业的扶持力度，大力推进农业产业化经营。农业产业化经营是农业结构调整的重要手段。如前所述，推进农业产业化经营的关键之一是搞好“龙头”建设。因此，政府要加大对“龙头”企业的扶持力度，为“龙头”企业的发展创造良好的发展环境。要加快对现有农产品加工企业的技术改造，鼓励采用新技术和先进工艺，提高加工能力和产品档次。要加大对现有农副产品加工业的改组、改造，把有市场、有效益的加工企业，改造成“龙头”企业。鼓励投资主体多元化，广泛吸引各类合作经济组织、社会民间资本和国外资本参与“龙头”企业建设。鼓励农业“龙头”企业到主产区建立生产基地，带动农民调整结构。
3、建立健全农产品信息体系、市场体系和质量标准体系。一是要建立和完善中央与地方的农业信息网络，强化省级农业信息体系建设，逐步建立健全县级农村经济综合信息服务体系，在有条件的地方要逐步将农村经济信息系统向乡镇和农户延伸。做好农产品生产信息、技术信息、价格信息和供求信息的收集与发布工作，为农民调整农业结构提供及时准确的信息。二是积极推进农产品市场体系建设，加强农产品储运、加工、包装及信息服务等市场配套设施建设。三是继续抓紧制订和修订农产品质量标准，建立健全农产品质量监督监测体系，积极开展农产品质量认证工作，完善农产品优质优价政策。
4、加强农业科技创新，为农业结构调整提供技术支撑。一是适应农业结构调整的要求，重新确立农业科技开发重点。农业科技开发重点要从主要追求增产技术转向追求优质高效技术，从以粮、棉、油、糖、畜禽等大宗农产品生产技术为主转到大宗农产品生产技术与特色农产品生产技术并重，从生产技术领域拓展到产后加工、保鲜、储运等领域。二是抓住关键技术，实行科技攻关。重点要围绕高科技育种技术、设施农业技术、节水农业技术、病虫害综合防治技术、生态农业技术、绿色无公害生产技术、工厂化生产技术、标准化生产技术，以及农产品精深加工技术、农产品保鲜储运技术、农产品质量监测与动植物检疫技术进行重点攻关。三是加强农技推广体系建设，加快农业科技成果应用步伐。当前，要为农民及时提供农业结构调整所需要的种子、苗木、种畜禽、菌种等，并为农民提供农产品加工、储运、销售过程中的技术问题。
5、加强农业基础设施和生态环境建设。结合标准化农产品基地建设，完善农田水利、道路、电力等基础设施，为农业结构调整创造条件。加强农业生态环境建设，为发展优质农产品提供环境条件。
