一、收回原发票直接按作废处理，重新开具发票。
《国家税务总局关于修订增值税专用发票使用规定的通知》（国税发〔2006〕156号）第十三条规定：一般纳税人在开具专用发票当月，发生销货退回、开票有误等情形，收到退回的发票联、抵扣联符合作废条件的，按作废处理；开具时发现有误的，可即时作废。作废专用发票须在防伪税控系统中将相应的数据电文按“作废”处理，在纸质专用发票（含未打印的专用发票）各联次上注明“作废”字样，全联次留存。
二、凭购买方出具的通知单开具红字专用发票后，重新开具发票。
由于专用发票作废条件相对严格，一些纳税人发现开具发票错误后，往往是跨月了或已经抄税等，对于这种不能作废的发票而又需要重新开具发票的，销货方应先开具红字发票冲销原发票，再重新开具正确的专用发票。
国税发〔2006〕156号第十四条规定：一般纳税人取得专用发票后，发生销货退回、开票有误等情形但不符合作废条件的，或者因销货部分退回及发生销售折让的，购买方应向主管税务机关填报《开具红字增值税专用发票申请单》（以下简 称申请单）。
三、销售方凭自己申请的通知单开具红字专用发票后，再重新开具发票。
对既不符合作废条件，同时购买方又未收到的增值税专用发票出现开票有误的 情况，开票方只能是在规定的期限内，自己向主管税务机关申请并按规定重新开票。《国家税务总局关于修订增值税专用发票使用规定的补充通知》（国税发 〔2007〕18号）规定了以下两种情况：
（一）因开票有误购买方拒收专用发票的，销售方须在专用发票认证期限内向主管税务机关填报申请单，并在申请单上 填写具体原因以及相对应蓝字专用发票的信息，同时提供由购买方出具的写明拒收理由、错误具体项目以及正确内容的书面材料，主管税务机关审核确认后出具通知 单。销售方凭通知单开具红字专用发票。
（二）因开票有误等原因尚未将专用发票交付购买方的，销售方须在开具有误专用发票的次月内向主管税务机关填报申请 单，并在申请单上填写具体原因以及相对应蓝字专用发票的信息，同时提供由销售方出具的写明具体理由、错误具体项目以及正确内容的书面材料。
四、发票因丢失，再重新开具发票
（一）根据增值税发票使用新规定，购方企业如果丢失增值税专用发票抵扣联、发票联中任何其中一份，无须销方单位到其主管税务开具已抄报税证明单，购方只凭其中未丢一份至其主管税务机关认证，通过即可抵扣，原件作记账凭证，复印件作扣税凭证备查。
（二）如果增值税专用发票抵扣联、发票联均丢失，就需由销方单位到其主管税务机关申请开具抄报税证明单。销方在发票开具当月丢失，销方主管税务机关不得出具此证明单,必须在次月企业报税完成后才能开具。开具此证明单时，必须有一方要处罚，处罚原则一事不二罚，谁丢失谁接受处罚。
1、如属购方丢失，购方凭借销方提供的记账联复印件先到所属税务机关接受处罚，并将税务机关处罚决定书原件邮寄或传真给销方，销方带公章、记账联复印件（2份）及购方提供的处罚决定书到所属税务机关申请开具抄报税证明单。销方将税务机关开具的抄报税证明单及记账联复印件提供给购方即可去购方所属税务机关认证抵扣。
2、如属销方丢失，销方携公章、记账联复印件（2份）到税务机关接受处罚并申请开具抄报税证明单，销方将税务机关开具的抄报税证明单及记账联复印件提供给购方即可去购方所属税务机关认证抵扣。
3、购方应及时携公章、抄报税证明单、记账联复印件（2份）至其主管税务机关申请补认证、补抵扣，税务机关受理时发放丢失发票认证、抵扣申请表二份，报经批准，认证。
