个税手续费是指发放给具体办税人的手续费的意思。个人所得税代征手续费，指代扣代缴个人所得税的公司，可以向当地的地方税务局申请，由税务机关付给代征税额２％的手续费，这是因为公司代扣代缴个人所得税，不属于公司的日常工作，而是为税务局工作，因此应当适当的予以报酬。
１、根据《中华人民共和国个人所得税法》第十七条规定，对扣缴义务人按照所扣缴的税款，付给百分之二的手续费。
２、根据《国家税务总局关于发布《个人所得税扣缴申报管理办法（试行）》的公告》第十七条规定，对扣缴义务人按照规定扣缴的税款，按年付给百分之二的手续费。不包括税务机关、司法机关等查补或者责令补扣的税款。
扣缴义务人领取的扣缴手续费可用于提升办税能力、奖励办税人员。
３、根据《关于进一步加强代扣代收代征税款手续费管理的通知》规定，“三代”税款手续费按年据实清算。代扣、代收扣缴义务人和代征人应于每年３月30日前，向税务机关提交上一年度“三代”税款手续费申请相关资料，因“三代”单位或个人自身原因，未及时提交申请的，视为自动放弃上一年度“三代”税款手续费。各级税务机关应严格审核“三代”税款手续费申请情况，并以此作为编制下一年度部门预算的依据。
2018年９月７日财政部发布的《关于2018年度一般企业财务报表格式有关问题的解读》第（二）点：“关于代扣个人所得税手续费返还的填列”中说“企业作为个人所得税的扣缴义务人，根据《中华人民共和国个人所得税法》收到的扣缴税款手续费，应作为其他与日常活动相关的项目在利润表的“其他收益”项目中填列”。据此，会计分录应当为：借：银行存款、贷：其他收益。该手续费返还可以用于奖励办税人员。
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