１、有限合伙企业比照个体工商户生产经营所得征税
根据财税［2000］91号文，合伙企业比照个人所得税法的“个体工商户的生产经营所得”应税项目，适用5%—35％的五级超额累进税率计算征收个人所得税。
但各地对有限合伙形式设立的股权投资企业制定了地方性政策。例如，上海地区规定，执行有限合伙企业合伙事务的自然人普通合伙人，按“个体工商户的生产经营所得”应税项目，适用5%—35％的五级超额累进税率，计算征收个人所得税。不执行有限合伙企业合伙事务的自然人有限合伙人，其从有限合伙企业取得的股权投资收益，按“利息、股息、红利所得”应税项目，依20％税率计算缴纳个人所得税。因此符合条件的有限合伙企业，自然人有限合伙人可以享受20％优惠税率，自然人普通合伙人，仍然适用五级超额累进税率计算缴纳个人所得税。
２、“先分后税”是指分配了再缴税
财税［2008］159号文规定，“合伙企业生产经营所得和其他所得采取‘先分后税’的原则”。认为“先分后税”是指先向合伙人分配利润，而后才需要纳税是一种误解。如果合伙企业的利润留存在企业，一直不作分配，合伙人则不需要缴税。
正确的理解“先分后税”：“先分”是指“应分配”的所得，而不是实际分配的金额。合伙企业的应纳税所得额中不仅包含分配给合伙人的利润，也包括应分而未分的留存收益。因此，即使合伙企业对其利润未做分配，也应该按照税法规定的分配比例，计算每个合伙人的应纳税所得额。
３、合伙企业本身不是纳税主体，由合伙人缴税
根据财税［2000］91号文，合伙企业以每一个合伙人为纳税义务人。但对合伙企业而言，被穿透的只是所得税。对于流转税而言，合伙企业仍然是纳税主体。财税［2016］36号文第一条规定，“在中华人民共和国境内销售服务、无形资产或者不动产（以下称应税行为）的单位和个人，应当按照本办法缴纳增值税。”因此合伙企业属于增值税的纳税主体，其生产经营所得应对照适用税率缴纳增值税。
从事股权投资的有限合伙企业，股权转让所得不需要缴纳增值税，但企业在二级市场出售股票的行为，应比照国家税务总局2016年第53号公告第五条对限售股买入价格的判定标准，按照“金融商品转让”品目缴纳增值税。
４、股息红利并入生产经营所得缴税
对于合伙企业取得的生产经营所得，财税［2000］91号文规定，按照每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，作为投资者个人的生产经营所得，适用5%—35％的五级超额累进税率，计算征收个人所得税。但对于合伙企业对外投资取得的股息红利所得，不并入企业的收入，应作为合伙人取得的股息红利，单独纳税。合伙人为自然人，“按‘利息、股息、红利所得’应税项目计算缴纳个人所得税”（国税函［2001］84号）；合伙人为法人，取得的股息红利由于不属于“居民企业直接投资于其他居民企业取得的投资收益”，因此不能享受居民企业之间的股息红利免征企业所得税政策，应并入法人合伙人当期应纳税所得额，缴纳企业所得税。
合伙企业需要缴纳增值税及附加（城建税、教育附加、地方教育附加）、水利基金、企业所得税、个人所得税、印花税，如果有房产还需要缴纳房产税和土地使用税。
合伙企业的合伙人按照下列原则确定应纳税所得额：
一是合伙企业的合伙人以合伙企业的生产经营所得和其他所得，按照合伙企业协议约定的分配比例确定应纳税所得额。
二是合伙协议未约定或者约定不明确的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人协商决定的分配比例确定应纳税所得额。
三是协商不成的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人实缴出资比例确定应纳税所得额。
四是无法确定出资比例的，以全部生产经营所得和其他所得，按照合伙人数量平均计算每个合伙人的应纳税所得额。合伙企业的合伙人是法人和其他组织的，合伙人在计算其缴纳企业所得税时，不得用合伙企业的亏损抵减其盈利。
１、申请人持相关材料向工商局注册登记服务窗口提出申请，经受理审查员初审通过，开具《受理通知书》；不符合受理条件的，在当场或者５个工作日内一次性告知申请人应当补正的全部材料（出具告知单），申请人按要求补正后即应受理并开具《受理通知书》；
２、对申请人申请材料齐全、符合法定形式的，在５个工作日作出核准或者驳回申请的决定；
３、在承诺期限日，申请人可以凭《受理通知书》到发照领取《合伙企业营业执照》。
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