私自改装发动机违法。
《道路交通安全法》规定任何单位或者个人不得改变机动车型号、发动机号、车架号或者车辆识别代号。
《道路交通安全法》第十六条 任何单位或者个人不得有下列行为：
（一）拼装机动车或者擅自改变机动车已登记的结构、构造或者特征；
（二）改变机动车型号、发动机号、车架号或者车辆识别代号；
（三）伪造、变造或者使用伪造、变造的机动车登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志、保险标志；
（四）使用其他机动车的登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志、保险标志。
私自改装机动车属于违法行为，但不扣分。
《中华人民共和国道路交通安全法》第一百条 驾驶拼装的机动车或者已达到报废标准的机动车上道路行驶的，公安机关交通管理部门应当予以收缴，强制报废。
对驾驶前款所列机动车上道路行驶的驾驶人，处二百元以上二千元以下罚款，并吊销机动车驾驶证。
出售已达到报废标准的机动车的，没收违法所得，处销售金额等额的罚款，对该机动车依照本条第一款的规定处理。
应当主动去交通管理部门申请备案，可以走如下程序。
《机动车登记规定》第十条 已注册登记的机动车有下列情形之一的，机动车所有人应当向登记地车辆管理所申请变更登记：改变车身颜色的；更换发动机的；更换车身或者车架；因质量问题更换整车的；营运机动车改为非营运机动车或者非营运机动车改为营运机动车等使用性质改变的；机动车所有人的住所迁出或者迁入车辆管理所管辖区域的。
依照新规定，允许车主不必再事先向车辆管理所申请，可以先更换车辆颜色、装了大包围、更换发动机等等之后，再向车辆管理所申请变更登记。
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