尼政府宣布从2002年7月1日起开始实施目的港商检，同时取消装船前商检。但因种种原因该项措施并未如期实行，可能将推迟至2003年初。新的商检制度与原来实施的商检制度有较大区别，为便于国内有关部门和企业很好地了解新的商检制度，现将装船前商检所作的变动及进口货物的清关程序介绍如下：
一、目的港商检制度下的一些重要变动
尼日利亚海关于2002年4月30日公布了从7月1日起执行的新的清关程序。以下是一些重要的变动：
1，在此新的系统下，不再进行装船前商检，到岸商检也不涉及到任何代理公司。
2， Form M仍然需要，另外开证银行须直接送一份复印件到海关。
3， 进口商的ASYCUDA号必须显示在Form M上。
4， 整个程序是建立在自我评估的原则上的，也就是说，在进口申报送抵海关进行审核前，海关税是由清关代理公司代表进口商计算并支付的。
5， 进口税是以当时递交SGD表(单笔货物申报表)给海关的时候的汇率计算的。
6， 重新引入Form Sale 123作为SGD表的一部分。在此表中，进口商正式向海关申报所进物品的详细内容。
7， 在缺少保险单的情况下，用于评估进口税的保险费，海运为货物价值的1.5%，空运为货物价值的0.5%。
8， 不再征收1%FOB价值的CISS费。
二、目的港商检制度下的清关程序
以下程序是从2002年7月1日起，所有进口货物到尼日利亚或清关的人必须遵守的。这些程序是基于自我评估原则之上的。这个原则是同尼日利亚联邦1990法第84条中《进口税和消费税管理条例》中的第三、四部份相一致的。
(一)进口商的责任
1. 任何人要进口货物到尼日利亚，首先要从尼日利亚海关阿布贾总部获得一个ASYCUDA的进口商号。在此前，进口商是向货物清关的地方海关关长申请该号的。
2. 任何人要进口货物到尼日利亚，必须要在他所选的银行填写Form M，并显示ASYCUDA号。
3. Form M必须明确说明是“可购外汇”或“不可购外汇”。
4. 在支付进口税和其它费用前，进口商必须确认他所进口的货物的准确位置。
5. 进口商须亲自支付进口税和其它费用。
6. 在以下情况，进口商必须填写并签字Form Sale 123(进口商须委托清关代理公司清关)或Form Sale 124(进口商有权自行清关)：
a. 真正的进口商，如果是单个的。
b. 合作者，如果是合作关系。
c. 董事或秘书，如果是公司。
(二)清关代理的责任
清关代理(海关所给予执照的代理)应该：
7. 向尼日利亚海关申请ASYCUDA清关代理号。
8. 向尼日利亚海关购买SGD表(单一货物申报表)，用于货物自我评估。
9. 进口税是在CIF价格基础上计算的，汇率以递交SGD表给CPC(海关处理中心)时为准。如果没有保险单，海运和陆运的保险费应以货物价值的1.5%来计算，空运为货物价值的0.5%来计算。其它应缴纳税为：
a. 征收“港口发展税”，为进口税的7%。
b. 从ECOWAS(西非经济共同体)外进口的货物，征收 “ECOWAS自由贸易计划”税(ETLS)，为CIF的0.5%。
c. 如果适用，国家汽车委员会(NAC)征收CIF的2%的税。
d. 如果适用，征收CIF的5%的糖税。
e. 征收CIF的5%的增值税(VAT)，进口税和其它应征的税。
10. 填写SGD表并附以下文件：
a. 进口商的Form M复印件(一个Form M用于一次交易或运输)。
b. 海运提单/空运提单/陆运提单。
c. 由开出Form M的银行背书的发票原件。
d. 保险单。
e. 装箱单。
f. Form Sale 123(进口商须委托有执照的清关代理公司清关)或Form Sale 124(进口商自行清关)。
g. 进口许可，如果有必要
h. 进口税付税表(Banks Pay-in-Slip and Customs)
i. 年收入
11. 把填写好后的SGD表和相关的文件递交给CPC(海关处理中心)的初审官员。
(三)银行责任
12. 银行应使所有由进口商处理的Form M正式化，并把原件送到尼日利亚海关，其它副件应按规定方式处理。
13. 为了制止外汇外流和借贷套利，所有进口货物是由T/T方式支付的，支付银行须进行补偿，以防止可能的转移，这样的补偿文件须送到尼日利亚海关用于监督。该文件在确认货物进口和清关后，应取回。
14. 银行须提供一个递送信件的带两套钥匙的袋/盒，用于给地区管理当局(Area Commands)递送付税表(Pay-in-Forms)和银行收据。
15. 银行官员在递交付税表和收据给地区计划官员(Area Schedule Officers)的时候，须在所有海关征税收据背面背书他的全名并签字。
16. 银行从它们不同的分行向中央银行(CBN)汇款时，须确保在地区与地区间的基础上通过一家指定银行来进行。
17. 银行应从海关地区会计处为每一个地区管理当局获得一个中央银行账号，以便它们能把海关税收汇入其相应账号。
18. 银行应当向每一个支付海关税和其它费用的人提供付税表。
19. 银行应当在每一个地区管理当局为所有可征收的税收，开立一个非支票/汇款的账号。
20. 指定银行所授权签字的人，应当带着介绍信去海关地区管理当局备案，并交付他们的签字样本和两张护照像片，同时应交付用于递送海关税收收据的信袋/盒的钥匙。
21. 汇款给中央银行是每周一次，每个星期一。汇款凭银行的中央银行支票，汇款计划书和IMP310表来进行。
22. 拉各斯，汇款到中央银行的分类办公室(Entries Office)，其它地区汇款到中央银行分行的银行业务办公室(Banking Office)。
23. 为每个地区管理当局准备的银行月报表，要显示收据号，日期，且每周全部转到中央银行的每一笔如同在IMP310中一样的税收金额，记为贷方，而减去的佣金记为借方。该银行月报表最迟送达海关地区管理当局的日期为次月的三号。
24. 银行须确保在每个月最后一天所签发的收据，在当天送抵海关地区管理当局。
25. 海关地区管理当局和指定银行每个月要进行一次账目核对。
