1、国际航行船舶检疫
申报项目：(1) 船名、国籍、预定到达检疫锚地的日期和时间；(2) 发行港、最后寄港；(3) 船员和旅客人数；(4) 货物种类；(5) 航海健康申报书。
出示证件：(1) 船舶除鼠或免予除鼠证书；(2) 船舶卫生证书；(3) 预防接种证书；(4)国际航线船舶员工健康证
查验程序：(1) 登轮后船长、船医应到场接受检疫；(2) 审阅航海健康申报书、除鼠正书或免予除鼠证书、船员名单、旅客名单、载货清单、预防接种及健康证书；(3) 流行病学调查；(4) 船员医学检查；(5) 交通工具卫生检查；(6) 签发《船舶入境卫生检疫证》
卫生监督和标准：(1) 环境卫生监督；(2) 了解饮用水和压舱水的来源、数量和装载日期等情况；(3)媒介生物的卫生监督；(4) 食品卫生监督；(5) 装载货物的卫生监督
卫生处理，指征：a.来自检疫传染病疫区；b.被检疫传染病污染的；c.发现有与人类健康有关的啮齿动物或者病媒昆虫，超过国家卫生标准的。方法：消毒、除鼠、除虫或者其他卫生处理。
电讯检疫，条件：a.必须持有中华人民共和国卫生检疫机关签发的船舶卫生证书；b.来自非疫区（霍乱、鼠疫、黄热病）；c.本航次船上未发生或未曾发生过传染病症状的病人，船上未载有死因不明的尸体；d.船上未发生过鼠类反常死亡；e.卫生检疫机关认为没有必需在锚地进行卫生处理的项目；f.备有效的国际航行检疫证件。符合上述条件申请电讯检疫的船舶在入境前24小时向卫生检疫
机关报告下列事项：a.船名、国籍、预定到达检疫锚地的日期和时间；b.发航港、最后寄港；c.船员和旅客人数及其健康情况；d.货物种类；e.船舶卫生证书的签发日期和编号、除鼠证书或免予除鼠证书的签发日期和签发港，以及其他卫生证件。经卫生检疫机关对上述报告答复同意后，即可进港。
2、小型船舶检疫
申报项目：(1) 填写好签证簿中入出境检疫申请部分内容；(2) 除鼠证书或免予除鼠证书签发港及日期；(3) 预防接种证书和健康证；(4) 载货清单。
出示证书：(1) 除鼠或免予除鼠证书；(2) 卫生检疫监管注册证及报验员证；(3) 卫生证书；(4) 国际旅行健康证书。
查验程序：(1) 审阅入出境检疫申请、国际旅行健康证书、船员名单、载货清单；(2) 检查卫生检疫监管注册证书、卫生证书、除鼠或免予除鼠证书、报验员证；(3) 流行病学调查及船员医学检查；(4) 船舶及货物卫生监督；(5) 签发《船舶入出境检疫证书》
卫生监督：(1) 环境卫生监督；(2) 媒介生物的卫生监督；(3) 货物的卫生监督。
卫生处理，指征：(1) 来自检疫传染病疫区；(2) 被检疫传染病污染的；(3) 发现有与人类健康有关的啮齿动物或者病媒昆虫，超过国家卫生标准的。方法，消毒、除虫、除鼠或者其他卫生处理。
