在合同拟定时，预付款条款一般要注意三个问题：
1、预付款的额度，比如按合同价的10％左右计算；
2、预付款的支付时间与方式，比如在合同签订后30日内支付预付款的50％，在承包人主要人员及主要机械到位后30日内再支付50％，支付预付款时承包人需提供预付款保函。
3、扣回工程预付款的时间和比例，比如在工程进度款支付至25％到75％之间按工程进度款比例扣回。
这三个方面一般没有强制性的规定，主要由招标单位根据实际情况灵活掌握，但不要对投标人过于苛求。
1、工程预付款的额度
建筑工程的预付款一般不宜超过当年建筑（包括水、电、暖、卫等）工程工作量的50％但也不能低于30％，大量采用预制构件以及工期在6个月以内的工程，可以适当增加比例。安装工程一般不宜超过当年安装工程量的20％，安装材料用量较大的工程可以适当增加。
2、工程预付款的扣回时间和方式
工程预付款应在工程开工后完成工程量达一定比例时在支付工程进度款时扣回或折抵进度款。折回或折抵的方式与比例应在合同中明确约定，如约定：“在完成年工程量总造价××％（以发包方代表签字确认的工程量报告为准）后的每月里，按每月工程进度款的××％扣回。在完成年工程量的××％扣完。”
3、运用担保手段降低风险
工程预付款支付的时间一般不迟于约定的开工日期前７天。为了能让工程预付款全部用于工程中而不被挪作他用，防止承包方收到工程预付款后不能按时进场施工，发包方可以在合同中约定由发包方对工程预付款的使用情况进行监督的办法。比如，规定特定的查帐方式或要求承包方提供购买材料的合同和发票等。另外如果支付的工程预付款数额较大，双方还可以协商约定承包方接受工程预付款的同时向发包方提供银行保函。当然，承包方也可以向业主要求出具支付保函。
1、预付款的数额没有任何限制；
2、预付款为主合同给付的一部分，当事人关于预付款的约定，具有诺成性，不以实际交付为生效要件；
3、预付款为价款一部之先付，在性质上仍属清偿；
4、预付款无双向或单向担保的效力，当事人不履行合同而致合同解除时，预付款应当返还。各方的违约责任通过合同约定的其他条款来定，如果没有约定违约责任的，一般不承担违约责任。
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