公司解除合同的赔偿金20万缴税多少，要看所在地区的工资水平才能确定的。经济补偿金征税的相关规定如下：
按国家规定：离职获得的经济补偿金当地上年职工平均工资3倍数额以内的部分，免征个人所得税，超过的部分才需要征税。例如：北京市2012年度全市职工平均工资为62677元，3倍就是：188031元，经济补偿金超过这个数额的部分，才需要征收个人所得税的。
经济赔偿金是企业超越法律规定解除或终止劳动合同时的一种惩罚性的赔偿，是违法行为所要付出的代价，其目的是惩罚性。我国《劳动合同法》第四十八条：用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同，劳动者要求继续履行劳动合同的，用人单位应当继续履行;劳动者不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，用人单位应当依照本法第八十七条规定支付赔偿金。其中第八十七条：用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。正是因为经济赔偿金是惩罚性的，所要在这里要二倍给付，这也是对《劳动法》的基础上提高了用人单位的违法成本。
1、关于工资所得个税与经济补偿金个税是否合并计算的问题。
劳动合同解除，员工工资所得与经济补偿金所得应当分别计算个人所得税。
2、关于因劳动合同终止所取得的经济补金的个税计算。
根据《劳动合同法》的规定，劳动合同到期终止，企业也需要向员工支付经济补偿金。对于员工因劳动合同终止所取得的经济补偿金的个税计算目前国家税法尚没有特别的规定，经向税务局了解，税务局的答复是：在国家没有出台特别规定之前，员工因劳动合同终止所取得的经济补偿金的个税计算不享受员工因劳动合同解除所取得的经济补偿金的个税计算的优惠待遇，应当按照所取得的经济补偿金数额根据国家《个人所得税法》的规定征收个人所得税。
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