（３）因提存而终止。提存是指由于债权人的原因而无法向其交付债的标的物时，债务人将该标的物提交给提存机关而消灭债务的一项制度。如保管合同履行期限届满后，寄存方下落不明或拒不提取保管标的物，保管方即可将标的物向有关部门提存，据此认定保管方的合同义务已经履行，当事人双方的合同关系终止。因此，合同因提存而终止可视为合同因履行而终止的一种特殊情况。
有下列情形之一的，保管合同的保管方可以将保管标的物向合同履行地的提存部门申请提存：①寄存人无正当理由拒绝受领或者不能受领的；②保管人无过失而确不知寄存人下落的；③寄存人丧失行为能力或者死亡而未确定监护人或继承人的（仅适用寄存人为自然人的情况）。如果保管合同的标的物不适于提存（如即将过期的食品，将要腐烂的水果等）或者提存费用过高的，保管方可以申请提存部门拍卖或者变卖标的物，提存所得的价款。保管方提存后，应当立即通知寄存方，保管方怠为通知的，应当对由此而产生的损害承担赔偿责任，寄存方下落不明的，保管方应当公告。提存期间，标的物的孳息（如价款利息）归寄存方所有。提存物的保管及拍卖、变卖费用，由寄存方负担。寄存方可以随时受领提存的标的物，但寄存方对保管方负有义务的（如尚未支付保管费），在寄存方未履行义务或者提供担保前，提存部门可根据保管方的要求拒绝其受领提存物。寄存方受领提存物的权利，自知道或者应当知道提存之日起一年内不行使而丧失。寄存人丧失受领提存物的权利后，提存物扣除提存费用后归国家所有。
（４）因双方协议而终止。保管合同中的双方当事人经协商一致，可以自愿终止双方相互之间的权利义务关系。因协议而终止包括权利人放弃自己的权利，从而免除义务人的义务；双方解除合同关系，可能出现两种情况：终止合同或实现合同的更新，即双方当事人订立一个新合同代替原合同。通过双方协议终止合同的，不论哪种情况，协议的内容都必须符合国家的法律和政策，不得违背社会公德和损害社会利益。
