商业特许经营合同将特许人与被特许人联接成为外在统一而内部独立的特许经营系统。商业特许经营法律关系内在的复杂性与多样性，商业特许经营合同的长期性与特许人与被特许人之间持续的合作共赢关系，均决定了商业特许经营合同的复杂性。商业特许经营合同类型综合的混合合同，审查商业特许经营合同应关注以下内容：
一、特许人与被特许人的基本情况
特许人与被特许人作为商业特许经营合同主体，基本情况在合同中非常重要。特别是特许人，《商业特许经营管理条例》对特许人的准入资格做了严格规定。如特许人必须为企业，必须具备“两店一年”的条件，必须具备为被特许人持续提供经营指导、技术支持和业务培训等服务的能力等。这些规定对于特许经营活动的开展具有重要意义，必须在合同中有明确体现。
二、特许经营授权的内容、方式、地域和期限
特许经营授权的内容、方式、地域和期限，是商业特许经营合同的核心条款，它规定了特许双方主要的权利和义务，也是容易引起纠纷的部分，所以一定要在合同中约定清楚，特别要明确约定是否允许被特许人经营其它业务。
三、特许经营费用的种类、金额及其支付方式
特许经营费用是特许经营的重要内容，种类繁多，包括加盟费、特许权使用费、广告推广基金、保证金、培训费等等，且其功能不同，一定要在合同中把每项费用的收费数额、方式、期限以及是否返还及返还的条件、时间等内容约定清楚。
四、经营指导、技术支持以及业务培训等服务的具体内容和提供方式
培训和指导是保证特许体系完整统一的重要手段。特许合同应明确规定培训和指导的内容、方式、费用承担等事项。培训指导通常包括开业前的人员培训、店址选择、店面设计、营销策划和后续支持。对被特许人来说，获得培训和指导是一项重要的合同权利。如果需要另行收费，应该在特许经营合同中明确约定。
五、保密、知识产权保护和限制竞争条款
在特许经营合同中约定知识产权的保护条款是非常重要的。特许人的经营资源是保障期发展特许经营事业的基础，一旦被违法、违规使用将会给特许人带来巨大的损失。特许人与被特许人作为各自独立的经营主体，应当在合同中对商业秘密的保护做出约定。另外，还要对经过发展后的技术归谁所有，被特许人是否可以继续使用等问题，在合同应中有明确约定。
