引起合同变更的法律事实不同则合同变更所适用的方式亦不同。合同变更的方式主要有两种：
1.合意。以这种方式变更合同实质上就是成立新合同以取代旧合同，故而合意变更合同的程序，应该遵循合同订立时的要约承诺规则，而且变更后的合同内容欲发生法律效力，也应符合合同的生效要件。此外，根据《合同法》第77条和第78条的规定，协议变更合同还应特别注意把握如下几点：
(1)当事人对合同变更内容约定不明确的，推定为未变更。换言之，如果就变更合同的意思表示没有达成一致，则原合同继续有效，当事人仍应按原协议执行。
(2)当事人就变更合同内容协商一致后，如果法律、行政法规规定变更合同应当办理批准、登记等手续的，必须依照规定办理相关手续才能发生变更的效力。
2.法院或仲裁机关的裁决。通过这种方式变更合同具体包括以下几种情形：
(1)因情势变更的出现，当事人一方可提出延期履行或部分履行的变更要求，但他并不享有单方变更合同的权利。因为情势变更的情况比较复杂，对合同履行的影响可能是全部的或永久的，也可能是局部的或暂时的，为避免出现债务人以此为借口逃避合同拘束的情况，应由法院或仲裁机关从维护双方当事人利益的角度出发，根据一方当事人的请求并结合情势变更对合同履行影响的程度，作出相应的变更裁决。
(2)因可归责于债务人的事由而致原合同没有履行，可以适用裁决的方式予以变更。例如，《民法通则》第108条规定，暂时无力偿还的债务，可以由法院裁决分期偿还。
(3)因重大误解或显失公平的合同，可裁决变更。根据《合同法》第54条规定，对于重大误解、显失公平和一方以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危损害另一方利益的合同，当事人一方可向法院或仲裁机关提出变更的请求，由法院或仲裁机关依法作出变更的裁决。
