《中华人民共和国种子法》第三十一条规定：从事种子进出口业务的种子生产经营许可证，由省、自治区、直辖市人民政府农业、林业主管部门审核，国务院农业、林业主管部门核发。以上海市为例，种子经营许可证在上海市农业委员会办理。
１、在本行政区域内申请从事主要农作物杂交种子及其亲本种子生产经营的，应当获得市农业委员会的行政许可。
２、在本行政区域内申请领取实行选育生产经营相结合、有效区域为全国的种子生产经营许可证的，应当获得市农业委员会的行政许可。
３、申请从事主要农作物常规种子或非主营农作物农作物种子生产经营，应获得企业注册所在区农业行政主管部门行政许可；注册地无农业行政主管部门的，由市农业委员会核发生产经营许可证。
根据《农作物种子生产经营许可管理办法》第十一条：申请领取种子生产经营许可证，应当提交以下材料：
（一）种子生产经营许可证申请表；
（二）单位性质、股权结构等基本情况，公司章程、营业执照复印件，设立分支机构、委托生产种子、委托代销种子以及以购销方式销售种子等情况说明；
（三）种子生产、加工贮藏、检验专业技术人员的基本情况及其企业缴纳的社保证明复印件，企业法定代表人和高级管理人员名单及其种业从业简历；
（四）种子检验室、加工厂房、仓库和其他设施的自有产权或自有资产的证明材料；办公场所自有产权证明复印件或租赁合同；种子检验、加工等设备清单和购置发票复印件；相关设施设备的情况说明及实景照片；
（五）品种审定证书复印件；生产经营授权品种种子的，提交植物新品种权证书复印件及品种权人的书面同意证明；
（六）委托种子生产合同复印件或自行组织种子生产的情况说明和证明材料；
（七）种子生产地点检疫证明；
（八）农业部规定的其他材料。
以上就是找法网小编为大家介绍的关于种子经营许可证在什么部门办理的相关内容。经营种子不同于经营其它的东西，一定要妥善的处理好种子，不要让种子发霉、变潮，不然种到地里的话是长不出来任何东西的，有这样的种子的话千万要扔掉。
