抵销权的行使其实是有诉讼时效的，因为归根结底抵销权还是属于民事权利的一种，那么根据我国民法总则的规定，所有的民事权利的诉讼时效都是三年，法律另有规定的则依照其规定。另外，从抵消权收到侵害之日起，如果超过了二十年，则人民法院不再保护。
破产法上的抵销权是在民法有关债务抵销规定的基础上形成，并针对破产程序的特点对民法抵销规定的条件作有扩张与限制。在破产程序中，无论双方债务给付种类是否相同，是否到期，或是否附有解除条件，均可相互抵销。在破产程序中，享有抵销权的仅为破产债权人单方，破产管理人与破产人不得主张抵销。抵销权应通过破产管理人行使。对附解除条件的破产债权，抵销时须提供担保，至分配除斥期满后债权仍成立者免除担保责任。附停止条件的破产债权因债权尚未成立，故不得主张抵销。破产债权人可主张对破产人的附条件债权进行抵销，视为其放弃条件利益。
《中华人民共和国民法总则》第一百八十八条第一款规定：“向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。”第二款规定：“时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护；有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。”
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