根据现行税法及国家税务总局相关文件，包括《关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》第二条“合伙企业合伙人是自然人的，缴纳个人所得税；合伙人是法人和其他组织的，缴纳企业所得税”之规定，涉及有限合伙企业税收问题的，其文件仅明确了“合伙人为自然人”，以及“合伙人为法人和其他组织(该其他组织显然应为法人制的，否则无须缴纳企业所得税)”之情形，对于合伙人本身也为“合伙企业”的情况，律师尚未发现有专门的税法文件予以明确。
但从合伙企业本身不作为其生产、经营所得的纳税义务人，而是采取“先分后税”并由其各合伙人分别纳税的操作原则和实践看，合伙企业从其所投资之有限合伙企业分配取得的所得，同样需采取“先分后税”的原则进行处理，其中合伙人为自然人的，缴纳个人所得税；而合伙人为法人的，则缴纳企业所得税。
关于合伙人为自然人时的个人所得税税率，是否能按照《国家税务总局关于〈关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定〉执行口径的通知》第二条“个人独资企业和合伙企业对外投资分回的利息或者股息、红利，不并入企业的收入，而应单独作为投资者个人取得的利息、股息、红利所得，按‘利息、股息、红利所得’应税项目计算缴纳个人所得税”之规定适用20%的税率缴纳个人所得税?关键在于判断合伙企业从其所投资之有限合伙企业分配取得的所得是否属于《个人所得税法实施条例》第八条“个人拥有债权、股权而取得的利息、股息、红利所得”的规定。在此认为，虽然《合伙企业法》仅明确合伙人从其所投资之合伙企业分配取得的所得是基于合伙人在合伙企业的财产份额获得，但根据上海市《关于本市股权投资企业工商登记等事项的通知》第五条的规定，本市实际上已经将合伙人对合伙企业的财产份额视为“股权投资”，并对以有限合伙企业形式设立的股权投资企业和股权投资管理企业中自然人的税收采取了与天津、北京不同的甄别办法，即仅从判断属于“执行有限合伙企业合伙事务的自然人普通合伙人”还是“不执行有限合伙企业合伙事务的自然人有限合伙人”来区别不同的税率，并不考虑合伙企业本身所得的性质划分。
